参考

  1. YouTube ligand-based 药效团建模 pharmacophore elucidate
  2. Structure-basd 药效团建模 PLIF

使用MOE进行药效团建模与分析相关推荐

  1. 基于配体的药效团建模和虚拟筛选研究设计新型HDAC2抑制剂

    摘要:组蛋白去乙酰化酶2 (HDAC2)属于组蛋白去乙酰化酶(HDAC)家族,已成为多种癌症治疗的治的重要治疗靶标.在Discovery Studio中使用3D-QSAR药效团生成(HypoGen算法 ...

  2. 基于药效团的药物设计(Pharmacophore Construction)

    基于药效团的药物设计(Pharmacophore Construction) 药效团模型不仅仅利用分子拓扑学相似性而且利用了基团的功能相似性,从而运用了生物电子等排体(bioisosterism)的概 ...

  3. 薛定谔分子对接、药效团、3D-QSAR

    文章来源公众号:科研讨论圈 时间 研讨会内容 内容 第一天上午 蛋白-配体相互作用 分子对接基础.原理及对接软件介绍 分子对接软件(薛定谔) 使用 2.1半柔性对接 2.1.1  小分子配体优化准备 ...

  4. 通过蛋白结构分析、同源建模、分子对接、虚拟筛选、构效关系分析、药效团靶点抑制剂筛选预测、全新药物设计,先导化合物发现等方法对靶点药物进行全方位设计及分析

    [一]专题目录 专题一:CADD药物分子相互作用.分子对接.靶点预测 2022年03月26日-03月27日 在线直播 2022年04月03日-04月04日 在线直播 专题二:薛定谔靶点抑制剂虚拟筛选. ...

  5. 分子模拟软件amber_分子模拟软件Discovery Studio教程(十):构建基于受体-配体复合物药效团模型...

    Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件,DS目前的主要功能包括:蛋白质的表征(包括蛋白-蛋白相互作用).同源建模.分子力学计算和分子动力学模拟.基于结构药物设计工 ...

  6. 基于蛋白-配体复合物药效团药物设计(Pharmacophore)

    基于蛋白-配体复合物药效团药物设计(Pharmacophore) step 1.蛋白-配体复合物准备 点击File-->Import Structures导入之前已经下载好的1IEP.pdb(A ...

  7. 基于药效团模型发现双重σ1受体拮抗剂和μ阿片激动剂

    摘要:报道了一系列新型1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷衍生物作为σ1受体(σ1R)和μ阿片受体(MOR)的有效双重配体的合成和药理活性.通过合成方法探索了使用两种靶标药效团模型合并的策略设计 ...

  8. 药效团模型(pharmacophore model)构建与搜索(MOE2018)

    记录一下完整的pharmacophore的过程 初始文件 复合物晶体结构->PLIF->药效团序列 加载蛋白复合物以及初始设置准备 1.读取蛋白文件 2.修改背景颜色为白色,修改立场文件 ...

  9. 酶抑制剂靶点预测:药物靶点评估/药效团筛选定制

    酶抑制剂靶点预测:药物靶点评估/药效团筛选定制 药物靶点评估 药物靶点通常是在代谢或信号通路中与特定疾病或病理状态有关的关键分子.通过绑定到特定活动区域抑制这个关键分子进行药物设计.多靶点药物发现途径 ...

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