生信的一些基本知识-p-value和富集分析与BP,CC,MF联系
01
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什么是P-VALUE?请用自己的语言简要概括，并举一例子
在假设原假设（H0）正确时，出现现状或更差的情况的概率。
在生物信息学差异分析的表达图中，p-VALUE代表的是显著差异，p值越小，代表这个基因的表达越显著，
举例：H0:硬币均匀，正反出现概率各为1/2。
这次实验我们抛10次硬币，发现有8次反面，那么在这里面出现的现状和更差的情况是8,9,10,0,1,2
那么他的p值为：0次反面的概率，1次反面的概率。2次反面的概率。8次翻面的概率，9次反面的概率，10次反面的概率的和相加
02
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在生信分析中，差异基因的富集分析，这个富集是什么意思？请用一个例子简要概括
富集富集，富集是要看跟谁比！在做富集分析隐藏的时候，要先看所有基因的平均表达量或者每个go富集的基因数，谁的表达量高，谁的基因数多那么这就是富集的，这个富集是通过对比求出来的
03
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在做富集分析的时候GO中的CC,BP,MF他们有什么联系?
每个数据库的功能及作用：
分子功能（Molecular Function，MF ）
单个的基因产物（包括蛋白质和RNA）或多个基因产物的复合物在分子水平上的活动，比如“催化”，“转运”
需要注意，这里的描述只表示活动，而不指定执行功能的实体（分子或复合物），动作发生的地点，时间或背景
广义上的例子是催化活性和转运蛋白活性。具体的例子是腺苷酸环化酶活性或Toll样受体结合
2、细胞组分（Cellular Component ，CC）
基因产物在执行功能时所处的细胞结构位置，比如在线粒体，核糖体
需要注意：细胞组分是细胞解刨结构，不指代过程
3、生物过程（Biological Process ，BP）
通过多种分子活动完成的生物学过程
例子是DNA修复或信号转导。更加具体的例子是嘧啶核苷生物合成过程或葡萄糖跨膜转运
理解了上述的概念，现在举个例子，如果站在基因本体论GO的角度来解释一个基因的话：
基因产物：细胞色素C（cytochrome c）
分子功能：氧化还原酶活性
细胞组分：线粒体基质
生物过程：氧化磷酸化
细胞组分有的时候可以决定分子的功能，分子根据他的功能参与生物的过程
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