开课背景

生物信息学说起来很好理解,可是对大部分想学习生信的人来说,操作起来却是有些棘手,无有头绪。生信的研究内容主要包括两个方面:首先,需要生物研究者利用实验收集、整理、储存、获取生物学数据;另一方面,需要依托数理信息科学的技术和方法管理和分析数据。如今工具开发者(IT)和工具应用者(Biologist)的界限越来越模糊,只要您是生信领域的工作者,都需要了解生物信息学分析基本知识。

生物学家产生数据的能力和兴趣是没有止境的,尤其随着现代测序技术的发展,生物数据的积累不断爆发。转录组是常用的分析解决生物问题的手段之一,如何做好转录组设计、分析转录组数据、解读转录组结果是必须的能力。Linux、Python、R是生物信息分析的三个程序基础,掌握基础原理和程序知识有助于我们提高转录组数据分析的效率。

生信学习是一个曲折的过程,但是只要你找准方向并坚持学习,就不难。为此,易生信在8月为大家推出一期连续5天的暑期线下课程,帮您清扫生信道路上眼花缭乱的障碍。本次培训课将从最基础的测序原理、数据挖掘入手,实践操作整套转录组数据的分析流程,让您有能力完成分析。然后再把流程拆解开,帮您实现自主定制分析和可视化。

课程安排

第一天 2018.8.8

  1. 高通量测序的应用、设计和案例分享
  2. 高通量测序原理、注意事项
  3. 转录组分析流程和结果解读
  4. Linux基础
  5. R基础

第二天 2018.8.9

  1. Linux软件安装套路和转录组分析软件自动安装
  2. 转录组分析实战和解读(比对、定量、差异、富集、WGCNA)

第三天 2018.8.10

Linux进阶-转录组分析流程的深入解读和结果转换提取

第四天 2018.8.11

R进阶-转录组数据挖掘和可视化(PCA,热图聚类,火山,富集图,箱线图等)

第五天 2018.8.12

Python编程实战-转录组分析结果提取和转换

您能学到什么

  1. 掌握二代测序原理和转录组项目设计、解读方法
  2. 掌握Linux、R和Python用于数据分析的技能
  3. 独立进行转录数据分析和解读的能力
  4. 转录组后续定制分析的能力
  5. 勤加练习即可快速入手同类分析方法

课程框架概览

主讲老师

主讲老师包括中科院微生物所、遗传发育所、基因组所、生物物理所等多名本领域一线技术专家。

刘永鑫,博士,中科院遗传发育所,微生物组专家,致力于16S和宏基因组的研究和推广,运营有数十万关注度的《宏基因组》微信公众号。

陈同,博士,2015毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业,在Cell Stem Cell,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万关注度的《生信宝典》微信公众号。

  1. Chen Tong*, Hao Ya-Juan*, Zhang Ying*, Li Miao-Miao*, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, Hao Jie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, Ping Xiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, Wang Xiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16, 289–301 (cover story)
  2. Cui Yi*, Xiao Zhifeng*, Chen Tong*, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing, Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified from collagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem cell differentiation. Stem Cells and Development 23, 4: 393-405. (*co-first author)
  3. Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.

助教团队

十余名科学院、清华、北大硕士、博士,轮值讲师和助教,辅助学员学习和矫正教授过程中不足的点。

课程福利

  1. 赠送价值约3000元的Linux、R、Python、转录组视频和教案(按照报名内容赠送相应在线课)
  2. 报名后即可进入学习群,助教发布学习计划,提前熟悉基础知识
  3. 学习群一直保留,供大家交流解决问题
  4. 提供易汉博基因科技兼职助教机会、实习机会或工作机会
  5. 报名还有优惠政策(见下方)

课程价格

最优惠价格:转发减500,五人同时报名各减500,赠送课程338,等同于2512元学习前两天的转录组。

时间地点

时间:

2018-08-08 到 2018-08-12 (五天线下讲解实战)

每天早9点到晚7点,半封闭式教学 报到时间:当天

地点:北京市西城区鼓楼明德大厦 (北京市旧鼓楼大街47号院2号)))

注意事项

  1. 需自备笔记本电脑,系统不限。课程实践需要会提供云计算平台
  2. 培训班所有数据,文档为内部资料,仅供参阅,未经允许不得翻印外传登刊
  3. 上课期间禁止录音,录像
  4. 成功付款的学员,若临时有紧急事情不能到来的,可申请延期,更换后续培训班;也可申请退款
  5. 若开课2周 (含) 前申请退款可退还85%费用;开课3个工作日 (含) 前申请退款退还70%的费用
  6. 不可先延期再退款

学习建议:

这次课程是把最开始的4门课程

(转录组、R、Python和Linux)

打包在一起的集中授课

前两天满足基本分析,后3天实现定制进阶

建议上课前听完赠送的视频课程(或视频节选),带着问题来

做的好这可能是你最后一次参加生信培训

报名网站: http://www.ehbio.com/Training

转录组研究

  • 39个转录组分析工具,120种组合评估(转录组分析工具哪家强-导读版)
  • 39个转录组分析工具,120种组合评估(转录组分析工具大比拼 (完整翻译版))
  • 无参转录组分析工具评估和流程展示
  • 120分的转录组试题 (第一份答案)
  • 120分的转录组试题(第二份答案)
  • 120分的转录组试题(第三份答案)
  • DESeq2差异基因分析和批次效应移除

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