mirna富集分析_课题研究实验外包高通量测序——miRNA测序
一、服务介绍
microRNA(miRNA)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达(最新发现miRNA也能在转录水平调控基因表达)。miRNA在物种进化中相当保守，在动物、植物和真菌等中发现的miRNA表达均有严格的组织特异性和时序性。miRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用，包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的miRNA测序，可以一次获得数百万条miRNA序列，能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下已知和未知的miRNA及其表达差异，为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。
二、分析项目
标准分析项目
1) 原始数据质控(去接头污染，去低质量reads)，数据产出统计；
2) 与参考序列比对；
3) 小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比对信息；
4) 小RNA与miRBase 中指定范围的已知的 miRNA的比对；
5) 按照优先级将小RNA进行分类注释；
6) 预测新的miRNA；
7) 差异miRNA分析；
8) 差异miRNA表达聚类分析；
9) miRNA靶基因预测分析
10) 靶基因功能富集分析
高级分析项目(以下分析选择分析结果较好的3~5个)
靶基因蛋白互作网络分析
miRNA功能协同网络分析
miRNA通路协同网络分析
miRNA共调控网络分析
miRNA活性分析
按照客户要求对兴趣miRNA进行深入分析；
重要miRNA的功能富集分析；
三、样本要求
RNA样品总量: ≥3μg
RNA样品浓度: ≥200 ng/μL
四、项目周期
45个工作日
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