CLUSTALW是一种渐进的多序列比对方法，先将多个序列两两比对构建距离矩阵，反应序列之间两两关系；然后根据距离矩阵计算产生系统进化指导树，对关系密切的序.

Linux_clustalW安装及使用首先解压压缩包tar -xzvf clustalw-2.1.tar.gz进到解压后的文件夹cd clustalw-2.1安装./configuremake进到下面这个文件夹cd src/运行即可./clustalw2.

clustalw是那种命令行格式的吧？这种不容易用，还是换个windows版的吧，比如clustalx，或者在线比对也行，比如http://www.ebi.ac.uk/tools/msa/clustalw2/。一般都是把几.

如题clustalw clustalx一样的吗？

clustalx是一个生物学序列比对软件.blast 是一套在蛋白质数据库或dna数据库中进行相似性比较的分析工具。blast程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。blast结果.

muscle 和 clustalw 是两个不同的 program， 你倒网上查查就知道了

做出来的话，会追加分数！！！

my $aln='s1.fa'； #需要输入的序列文件，多个序列必须在一个文件中。my $clustalw = ＂d:/ClustalW2/clustalw2＂; #clustalw的安装路径my $tempoutput='aa.aln'； #输出文件.

多序列比对一般通过3个步骤完成：(1)两两进行双重比对。(2)生成一系统树图(dendrogram)，将序列按相似性大致地分组。(3)使用系统树图作为引导，产生出最终的多.

您好，我来为您解 不知道你说的刚入行是指刚用perl，还是bioperl，还是没有用过OO？ 那你还是先看面向对象(Object-Oriented)方面的东西，然后Bioperl就好理解.

有谁了解，告一声。

好象是生物学试验设备产生的文件吧，以前看过DNA分析出的文件也是这类怪怪的格式。aln文件好象是DNA分析里的什么蛋白质序列文件，是clustalw软件生成的，可以用.

phylogram是什么意思？A phylogram was created using the ClustalW 。

系统发育图(phylogram)其他：phylozone 系统发育带 phylum 门 phymatopleura 肿肋螺属 physiatrics 物理疗法 physical acoustics 物理声学 physical address bus 实际地址.

什么是序列同源性！能举例子否？

同源蛋白质的氨基酸序列具有明显的相似知性，这种相似性称为序列同源性。具有序列同源道性的蛋白质称为同源蛋白质，同源蛋白共有的相似序列称为共义序列。(一).

CodonCode Aligner是一个领先的DNA序列分析软件，可用来DNA测序trace图编辑. 包括比较ClustalW和肌肉的DNA重叠比较，锐化，往返编辑，以及基本的PHRED，还.

1、打开相关的窗口，直接按照图示的顺序进行选择。2、这个时候弹出新的对话框，需要勾选Note下面的方框。3、下一步如果没问题，就通过点击Run ClustalW来确定。.

EMBL-EBI http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html？ 限制500条，超。

可能这是网页版的局限，我也没有同时比过这么多的序列。但是我想你用线下的MEGA软件就应该不会有数量的限制了。www.megasoftware.net/去下载一个mega，然后本.

比如我想查金黄色葡萄球菌NUC基因与其他葡萄球菌NUC基因之间的比对 找.

建议使用clustalw，进行多序列比对，可以满足你上面说的要求。

请问您当时是怎么解决的？？？

你好！通常情况下是序列个别碱基还存在问题，比如有空格，字母错，重新再检查输入一遍 如有疑问，请追问。

做成TXT文件，找load sequence.不建议用bioedit做序列分析与比对，不好.可用clustalW或mega4.

多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证. 以及在分子进化分析方面均有很大帮助，ClustalW(Dos版本)很适合这些方面的要求，.

如果是只有DNA序列的话，直接在TXT文件里按照FASTA格式书写，写完后把后缀的txt改为fasta就行了，但是我在WINDOWS的环境下该完的文件clustalw不认，只有在.

要构建进化树需要先安装哪些工具？

序列比对建议用ClustalX 建NJ或MP树，用MEGA就可以了，非常方便 若要建ML树推. 虽然多雪列比对工具ClustalW/X自带了一个NJ的建树程序，但是该程序只有p- .