Ubuntu20.04安装gamit10.7

在gamit安装过程中，由于卡在了一些奇奇怪怪我无法解决的问题上，先后在Ubuntu18.04和20.04上，尝试了一个gamit10.7和两个gamit10.71安装包，最后通过Ubuntu20.04和gamit10.7顺利安装。之前安装好的被杀毒软件给清了，把这次重新安装的过程纪录下来以备后用。

1.应用中找到终端打开，或ctrl+alt+t打开终端

（1）输入 sudo passwd root，回车——设定root 的密码，会需要输入之前用户的密码，及新的 root 账户的密码，输入的密码不会显示

（2）su root ——登录root

（3）修改/usr/share/lightdm/lightdm.conf.d/50-ubuntu.conf文件

gedit /usr/share/lightdm/lightdm.conf.d/50-ubuntu.conf ——打开文件进行编辑

末尾增加下面两行：

greeter-show-manual-login=true

all-guest=false

修改后为：

[Seat:*]

user-session=ubuntu

greeter-show-manual-login=true

all-guest=false

点击保存后退出文件编辑

（我看到的一个教程说要进行如下步骤，但是我找不到该文件，于是选择了上面的操作。

“备份一下 lightgdm
cp -p /etc/lightdm/lightdm.conf /etc/lightdm/lightdm.conf.bak

sudo gedit /etc/lightdm/lightdm.conf
增加：
greeter-show-manual-login=true
修改后为：
[SeatDefaults]
greeter-session=unity-greeter
user-session=ubuntu
greeter-show-manual-login=true”）

（4）注释

sudo gedit /etc/pam.d/gdm-autologin

注释掉auth required pam_succeed_if.so user != root quiet_success这一行(第三行左右)

sudo gedit /etc/pam.d/gdm-password

注释掉 auth required pam_succeed_if.so user != root quiet_success这一行(第三行左右)

（5）修改/root/.profile文件

gedit /root/.profile

将文件末尾的mesg n 2> /dev/null || true这一行修改成

tty -s && mesg n || true

保存文件。

2.软件源的配置

在应用里找到“软件和更新”，打开，“下载自：”一栏选择其它站点，选择一个国内的源即可，也可以点击右上角的“选择最佳服务器”进行选择。

打开终端，输入： apt-get install update

更新完成即可。

3.安装gcc g++ gfortran

（1）由于版本5、6在Ubuntu20.04中不支持无法直接安装（如图），gfortran7存在bug会导致编译失败，所以在安装前需要先添加源。

打开终端使用root账号

编辑sources.list，输入：sudo vim /etc/apt/sources.list

可能会提示vim找不到命令，则需要下载vim后再进行上面那步操作： sudo apt-get install vim-gtk

然后添加源，即在文件末尾输入：

deb http://gb.archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic main universe

编辑好后，按esc键，然后输入“：wq”从而保存退出。

更改完成后在终端输入如下命令：

sudo apt-get update

sudo apt upgrade

参考资料：https://blog.csdn.net/AMST_J/article/details/115396964?utm_source=app&app_version=5.4.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

（2）在终端中依次输入以下命令，遇到提问则输入Y回车，也可以只安装6不安装其它。

【1】安装gcc g++ gfortran多版本
sudo apt-get install gcc-5 gcc-5-multilib g++-5 g++-5-multilib gfortran-5 gfortran-5-multilib
sudo apt-get install gcc-6 gcc-6-multilib g++-6 g++-6-multilib gfortran-6 gfortran-6-multilib
sudo apt-get install gcc-7 gcc-7-multilib g++-7 g++-7-multilib gfortran-7 gfortran-7-multilib

【2】设置gcc g++ gfortran优先级
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-5 70
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-6 60
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-7 50
sudo update-alternatives --install /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-5 70
sudo update-alternatives --install /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-6 60
sudo update-alternatives --install /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-7 50
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gfortran gfortran /usr/bin/gfortran-5 70
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gfortran gfortran /usr/bin/gfortran-6 60
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gfortran gfortran /usr/bin/gfortran-7 50
【3】选择gcc和g++ gfortran版本
sudo update-alternatives --config gcc
sudo update-alternatives --config g++
sudo update-alternatives --config gfortran

4.安装csh、tcsh、libx11-dev、ncftp、gmt、curl、make

在终端中依次输入以下命令（如果登录了root账号，可以不加sudo）：

sudo apt-get install csh

sudo apt-get install tcsh

sudo apt-get install libx11-dev

sudo apt-get install ncftp

sudo apt-get install gmt

sudo apt-get install curl

sudo apt-get install make

5.配置gmt环境

sudo gedit ~/.bashrc

在文档末尾添加如下三行，并保存退出。

# PATH for GMT

export NETCDFHOME="/usr/lib"

export GMTHOME="/usr/lib/gmt"

export PATH="$PATH:$GMTHOME/bin"

然后终端中执行，输入：source ~/.bashrc

6.将gamit10.7安装包复制到/opt目录下，或者其它目录也可以，我复制到/opt下会报错于是选择了主目录，也可以直接共享文件夹后在/mnt目录下找到该文件。

最好不要将文件复制到桌面上，或者复制后要记得移动到其它目录下，否则，很可能会导致桌面存储空间占用而无法正常开机。

如果gamit安装包为zip或者rar格式，则需要先在安装包所在文件夹页面点击鼠标右键，进入终端，先将安装包进行解压。

zip文件：

sudo apt-get install unzip

unzip xxxxx.zip

rar文件：

sudo apt-get install rar

sudo apt-get install unrar

sudo unrar x name.rar

如果解压后的，安装包里的文件夹带锁，则在带锁文件夹所在目录里打开终端，将文件夹解锁：sudo chown -R username filename

7.在解压后的gamit文件夹所在目录打开终端，登录root账号，输入：

chmod +x install_software

./install_software

之后遇到询问直接点y，直到第二次或第三次询问X11路径时，不要点y，开启另外一个终端，用gedit编辑gamit文件夹里libraries目录下的Makefile.config文件，对该文件做以下修改：

5.1 修改 X11 的路径
需要做的是将文档中 X11 的路径从
X11LIBPATH /usr/lib/X11
X11INCPATH /usr/include/X11
修改为
X11LIBPATH /usr/lib/x86_64-linux-gnu
X11INCPATH /usr/include/X11

5.2修改 GAMIT 的一些内部参数
分别是MAXSIT（最大测站数）、MAXSAT（最大卫星颗数）、MAXATM（最大天顶延迟）和MAXEPC（最大历元数）。这里需要改的将MAXSIT改为99，MAXSAT改为40，MAXATM改为25，MAXEPC改为8640。
修改前：
MAXSIT 80
MAXSAT 32
MAXATM 13
MAXEPC 2880
修改后：
MAXSIT 99
MAXSAT 40
MAXATM 25
MAXEPC 8640
5.3检查 Linux 操作系统版本号
Ctrl+F 查找“Linux"
OS_ID Linux 0001 4930
另开一个终端，输输入命令查看自己的 Linux 版本： uname -a
只需记住linux版本的前四位编号，如果小于4930，不需要修改，如果大于4930，则修改为自己的linux版本的前四位编号。笔者的linux版本4.4.0-17763-Microsoft，则编号为4400，小于4930不需修改。

上面的第三步，我把编号改成4400会在之后的安装过程中报错，需要改成4401。

修改的文件保存后退出。

8.回到之前的终端里，遇询问直接输入y回车。可能会出现询问X11路径时，输入y后提示“……（我忘了）and re-run this script.”结束安装的情况，那么就重新再输入“chmod +x install_software”和“./install_software”后，一路输入y进行安装。如果没有意外，就可以等待它安装结束了。

9.安装完成后会提示：

+++++++++++++
GLOBK installed
+++++++++++++
Greate the gg link in your home directory to the version of gamit/globk you just
installed?(y/n)

输入y，则主目录下有了指向gg的快捷方式。如果主目录下没有出现，可以参考以下方法处理：

https://blog.csdn.net/qq_41168319/article/details/109032373?utm_source=app&app_version=5.5.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

10.配置 GAMIT 环境变量

在终端中输入：sudo gedit ~/.bashrc
打开.bashrc 文档后，将以下代码加在在文档末尾：
# PATH for GAMIT
export PATH="$PATH:/opt/gamit10.7/gamit/bin:/opt/gamit10.7/com:/opt/gamit10.7/kf/bin"
# export HELP_DIR="/opt/gamit10.7/help/"
export HELP_DIR=/opt/gamit10.7/help/
需要注意的是，这里的路径必须是用户自己安装 GAMIT 的路径，不要照搬这里的代码。然后保存退出，在 bash 下加载刚才修改的文件，在终端中运行：
source ~/.bashrc

如果shell是csh，则需要编辑.cshrc文件。

https://blog.csdn.net/m0_65958744/article/details/124984207?utm_source=app&app_version=5.5.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

11.重启Ubuntu，登录root账号后，输入以下命令验证是否安装和配置成功：

doy
sh_get_rinex

其中，doy 命令回车后显示帮助文档，则说明 GAMIT 安装成功，环境变量也配置成功。若报错，输入 sh_get_rinex 回车后显示说明文档，则说明 GAMIT 安装成功，但环境变量未配置成功，检查 d）步骤是否操作正确，尤其是符号的输入是否正确。

参考链接：

https://blog.csdn.net/weixin_41240651/article/details/105359953?utm_source=app&app_version=5.5.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

https://blog.csdn.net/lomefeit/article/details/108637740?utm_source=app&app_version=5.5.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

https://blog.csdn.net/u011322358/article/details/104246181?utm_source=app&app_version=5.5.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen

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