#下载
/media/wh/20T_1/Bama_pig/wangdong/APP/sratoolkit.2.11.1-centos_linux64/bin/./prefetch SRR2172038
#转换格式FASTQ
/media/wh/20T_1/Bama_pig/wangdong/APP/sratoolkit.2.11.1-centos_linux64/bin/./fastq-dump SRR2172038.sra
#后台运行
nohup left.sh > /dev/null 2>&1 &
#下载数据超过20G时./prefetch --max-size 50G SRR1216770
#帮助文档./prefetch -h

从NCBI下载SRA数据相关推荐

  1. NCBI下载SRA数据的4种方法

    作为生命科学的从事者,不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Information Search database,一个综合性的生 ...

  2. 批量下载sra文件linux,NCBI下载SRA数据的4种方法

    作为生命科学的从事者,不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Information Search database,一个综合性的生 ...

  3. linux 下载sra数据库,NCBI下载SRA数据和之后的数据处理

    一,下载该软件 wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz ta ...

  4. 批量下载sra文件linux,Linux下从NCBI批量下载SRA数据的sra和aspera方法

    Minus_yao  2018.04.25  yaoguocai_cool@163.com #从NCBI下载SRA数据,最近在疯狂下载宏基因组数据,试着解决一下这个问题~ 方法一: 软件准备: 使用n ...

  5. Linux下从NCBI批量下载SRA数据的sra和aspera方法

    Minus_yao  2018.04.25  yaoguocai_cool@163.com #从NCBI下载SRA数据,最近在疯狂下载宏基因组数据,试着解决一下这个问题~ 方法一: 软件准备: 使用n ...

  6. NCBI中SRA数据下载

    NCBI中SRA数据下载 hs6605015 2020-08-02 14:35:34  1170  收藏 8 版权 应用场景: 如果自己没有测序数据,比如Pacbio数据,nanopore数据等,想要 ...

  7. 下载NCBI的SRA数据 详细教程

    SRA(Sequence ReadArchive)数据库是NCBI(National Center for Biotechnology Information)旗下用于存储高通量测序数据的子库.来自世 ...

  8. 干货分享 | Windows系统下载SRA数据方法——生信小白亲测可行

    在开展二代测序相关课题研究时,经常需要上传或者下载SRA数据库中的数据,对熟悉Linux系统.懂代码的同学们来说是非常容易的事情.但像小编这一类看到代码两眼一抹黑的小白就有点难度了,尤其电脑还是Win ...

  9. Windows系统下载SRA数据,使用sratoolkit工具

    上次写了在linux环境下从ncbi下载sra文件,这次因为ncbi的这个网站找不到ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra ...

最新文章

  1. Microsoft Exchange Server 2010测试四成员DAG
  2. UM功能实现和配置技巧(上)--语音邮件、传真功能
  3. 【转】Android兼容性测试CTS Verifier-环境搭建、测试执行、结果分析
  4. Python初学者之ImportError: No module named moviepy.editor 的解决办法
  5. unresolved external symbol怎么解决_收藏!用Kubernetes和PKS 1.5解决Windows Server2008的问题...
  6. CocoaAsyncSocket 套接字
  7. 杭电acm 提交代码需要注意的问题
  8. Linux命令整理-Ubuntu
  9. springboot整合shiro之实现记住我
  10. 高等代数第3版下 [丘维声 著] 2015年版_一文搞懂代数几何发展史(一)
  11. 分享 AI 圣经 PRML《模式识别与机器学习》百度云链接
  12. TwinCAT 3 马达程序
  13. 暨南大学人文社科a类期刊_暨南大学A类期刊目录.pdf
  14. 大数据时代:七种常见的数据挖掘方法
  15. f2fs系列文章gc
  16. 阿正喜欢的演讲系列连载(一):大法官约翰·罗伯茨-我祝你不幸(I Wish You Bad Luck)
  17. Magento(CE1.X)自带模块解析五
  18. vue中的attribute 和 property 是什么意思
  19. 霍夫变换c语言程序,霍夫变换 | Cauthy's Blog
  20. 如何使用在线客服转接功能

热门文章

  1. Dreamweaver cc 2018下载及安装
  2. 掌控版实现抢答器功能
  3. 机器学习:begging复习
  4. 123457123457#0#----com.ppGame.YinYu45--前拼后广--儿童yinyu-pp
  5. python批量图片大小处理-多文件夹
  6. 【无人机取证篇】无人机数据存储位置
  7. 基于无人机影像结合Arcgis、Agisoft Metashape软件计算林地面积探讨
  8. linux文档_Linux文档
  9. 无授权转载:大神的日语学习方法
  10. 计算机信息系统的国内研究趋势,管理信息系统的研究背景及国内外现状