生物信息中的卷积和反卷积
先看一下数学中的卷积:
卷积就像加减乘除一样是一种运算,只是低等数学用不到,就没教,它是指:把二元函数 U(x,y) = f(x)g(y) 卷成一元函数 V(t) ,俗称降维打击。
在bulk RNA的中,就是把平均值看作单个细胞表达值与某个函数(和检测方法有关)的卷积。获得样本bulk RNA 表达量的过程,就是一个卷积的过程,而反卷积,是卷积运算的逆运算。
举例:使用实体肿瘤来源和PBMC(外周血单核细胞)来源的single-cell RNA测序数据,通过数据处理获得相应的特定指标和特定类型的细胞亚型的基因表达谱(RGEPS)推导普通转录组数据中的细胞亚型和细胞比例。这种方式在数学上叫做反卷积。
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