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Fisher’s exact test

  1. For all possible tables (with the observed marginal counts), calculate the relevant hypergeometric probability.

  2. Use that probability as a statistic.

  3. P-value (for Fisher’s exact test of independence) = the sum of the probabilities for all tables having a probability equal to or smaller than that observed.

输入1:

2,

结果1:

            阳性 阴性非预防组     18    2预防注射组   11    9

输入2:

fisher

结果2:

's Exact Test for Count Data

输入3:

function

结果3:

[1] 0.03095031

输入4:

install.packages("ggplot2")library(ggplot2)dhdata <- data.frame(x=factor(c(9:20)),y=dhyper(9:20,29,11,20))dhdata$group<-factor(ifelse(dhdata$x==18,"x=18","other"))ggplot(dhdata,aes(x=x,y=y,color=group))+geom_point(size=5) +geom_segment(aes(xend=x,y=0,yend=y),size=1.5,linetype="solid")+geom_text(aes(label = round(y,3), y=y+0.01))+theme_bw(base_size = 14)

结果4:


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