多元有序logistic回归_医学统计与R语言:多分类logistic回归HosmerLemeshow拟合优度检验...
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输入1:multinominal logistic regression
install.packages("nnet")library(nnet)multinom.fit type ~ grade+ ki67,data =repdata)install.packages("generalhoslem")library(generalhoslem)logitgof(repdata$type, fitted(multinom.fit))
结果1:
Hosmer and Lemeshow test (multinomial model)
data: repdata$type, fitted(multinom.fit)X-squared = 2.4313, df = 6, p-value = 0.8761
输入2:ordinal logistic regression
install.packages("MASS")library(MASS)hsblog data=hsb)rlog 10, ord = TRUE)rlog
结果2:
Hosmer and Lemeshow test (ordinal model)
data: hsb$SES, fitted(hsblog)X-squared = 11.985, df = 17, p-value = 0.801
输入3:
rlog$observed
结果3:
cutyhats y_1 y_2 y_31 [0.801,20.9] 11 8 12 (20.9,40.8] 7 8 53 (40.8,60.7] 6 9 54 (60.7,80.6] 5 13 25 (80.6,100] 4 12 46 (100,120] 3 12 57 (120,140] 5 9 68 (140,160] 4 7 99 (160,180] 2 8 1010 (180,200] 0 9 11
输入4:
rlog$expected
结果4:
cutyhats y_X1 y_X2 y_X31 [0.801,20.9] 10.120410 8.142919 1.7366712 (20.9,40.8] 8.108725 9.424321 2.4669543 (40.8,60.7] 6.451121 10.197968 3.3509114 (60.7,80.6] 5.261742 10.517550 4.2207085 (80.6,100] 4.423645 10.544177 5.0321786 (100,120] 3.789118 10.410028 5.8008547 (120,140] 3.165314 10.101676 6.7330108 (140,160] 2.638453 9.644972 7.7165759 (160,180] 2.036237 8.807769 9.15599510 (180,200] 1.307455 7.099798 11.592747
前文链接:
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