《生物信息学》阅读笔记 (二):生物学数据库及其检索
- 目前生物学数据库的四种类型:平面文件、关系型数据库、面向对象数据库和基于Internet平台的XML。
- 人类基因组计划的主要目标:获取完整、准确、高质量的人类基因组序列。
- 生物学数据存放类型:序列、三维结构、文献、序列特征、基因组图谱、表达谱等。
- 二级数据库则是在一级数据库的信息基础上进行了计算加工处理并增加了许多人为的注释而构成的。
如何查找与研究相关的生物学资源:
- 利用公共搜索引擎
- 了解重要的生物信息学门户站点:NCBI、EBI、EMBnet
- 利用Nucleic Acid Research 杂志每年的数据库专辑/网络服务器专辑
- 生物学数据库的检索:Omictools 和DATO
感觉目前对数据库检索这块还是NCBI用的最多
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