eLife（IF：8.713）发表武汉大学逯杨/苏畅团队白念珠菌半乳糖代谢信号通路分子机制
近日，eLife（IF：8.713）在线发表了武汉大学逯杨/苏畅团队题为“Recognition of galactose by a scaffold protein recruits a transcriptional activator for the GAL regulon induction in Candida albicans”文章。该研究发现共生病原真菌Ndt80家族的转录因子Rep1与半乳糖分子直接结合后，招募转录激活因子Cga1，共同调控白念珠菌半乳糖代谢基因的表达。爱基百客为该研究提供ChIP-seq的技术支持。
内容速递
非致病性模式生物酿酒酵母中的GAL途径（半乳糖代谢信号通路）长期以来一直是理解真核生物代谢途径的调控模式如何演变的模型系统。虽然Gal4模式在酵母菌科分支中已经得到了很好的描述，但对其他酵母（比如致病性模式生物白念珠菌）中GAL通路的调控知之甚少。在该研究中，作者发现Rep1，一个Ndt80样家族转录因子，在共生致病性真菌白色念珠菌中作为半乳糖传感器。它出现在GAL基因启动子上，独立于半乳糖的存在。Rep1通过直接的物理相互作用来识别半乳糖。
Rep1和Ndt80均属于Ndt80样转录因子家族。在研究中作者发现Rep1调节半乳糖和GlcNAc的分解代谢，而文献资料显示Ndt80是生物膜形成的主调控因子。表型的差异应该是由于这些调控因子之间的靶基因差异，为此，作者利用Myc标记的Rep1染色质免疫共沉淀（ChIP-seq），鉴定了由Rep1直接调控的基因。在ChIP-seq检测中，半乳糖分解代谢基因（GAL1,7和10）和GlcNAc分解代谢基因（DAC1和NAG1）都被鉴定为Rep1的直接靶点。然后，作者使用GO对Rep1的靶基因进行通路分析，结果显示其在不同的过程中富集，包括对细胞外刺激的反应、碳水化合物代谢过程、细胞器分解。随后，在半乳糖或甘油条件下进行了qRT-PCR分析。除GlcNAc和半乳糖分解代谢基因外，当REP1缺失时，作者检测的其他Rep1靶基因的表达均有所增加。
（Sun X, et al. ELife. 2023）
论文链接：DOI: 10.7554/eLife.84155
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