Linux 服务器上安装 Virtuoso 数据库 并导入数据（超详细）
Virtuoso安装
- 一、Virtuoso简介
- 二、Virtuoso下载
- 三、Virtuoso安装与启动
- 1. 在当前用户目录新建目录`virtuoso`并进入该目录：
- 2. 将下载好的压缩包放入此目录并解压：
- 3. 进入`virtuoso-opensource`目录并配置：
- 4.使用vi命令配置用户环境变量
- 5.启动Virtuoso服务
- 6.查看Virtuoso可视化主界面
- 四、数据导入
- 1.可视化界面导入数据
- 2.命令行中`isql`语句导入数据
- 五、其它
- 1.virtuoso.ini设置
- 2.References
一、Virtuoso简介
(1) virtuoso数据库是一个高性能的rdf数据库，可支持百亿条三元组，支持sparql1.1语法查询。
(2) Virtuoso是一个图数据库，同时支持SparQL。
二、Virtuoso下载
开源版本的virtuoso数据库(以7.2.6为例)，下载地址点击此处 ，然后下载第一个最大的压缩包即可！
三、Virtuoso安装与启动
以我的linux服务器用户目录/home/spence为例：
1. 在当前用户目录新建目录virtuoso并进入该目录：
spence@main-server-8:~$
mkdir virtuoso
spence@main-server-8:~$cd virtuoso
spence@main-server-8:~/virtuoso$
2. 将下载好的压缩包放入此目录并解压：
spence@main-server-8:~/virtuoso$
tar -zxvf virtuoso-opensource.x86_64-generic_glibc25-linux-gnu.tar.gz
解压成功后目录内容如下：
3. 进入virtuoso-opensource目录并配置：
进入virtuoso-opensource/database/目录：
spence@main-server-8:~/virtuoso$
cd virtuoso-opensource/database/
复制并重命名virtuoso.ini.sample为virtuoso.ini：
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
cp virtuoso.ini.sample virtuoso.ini
4.使用vi命令配置用户环境变量
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
vi ~/.bashrc
然后加入以下语句，记得更改语句中用户路径为你自己的用户路径，即语句中的/home/spence：
export VIRTUOSO_HOME=/home/spence/virtuoso/virtuoso-opensource
export PATH=.:${VIRTUOSO_HOME}/bin:$PATH
保存后退出，然后使用以下命令使环境变量配置生效：
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
source ~/.bashrc
5.启动Virtuoso服务
为了启动Virtuoso之后我们仍然能进行其它操作，此处我使用screen命令新开虚拟窗口，你也可以使用其它命令诸如nohup命令使得Virtuoso服务在后台运行。
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
screen -S vir
然后启动Virtuoso服务：
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
virtuoso-t -fd
出现以下内容说明服务启动成功！
*从日志信息可以看出此时服务运行于默认的8890端口（你也可以在前面的virtuoso.ini配置文件中设置运行端口）
服务启动后，你可以使用快捷键ctrl-A + ctrl-D返回主窗口(screen)进行其它操作。
6.查看Virtuoso可视化主界面
在本地打开浏览器，以Chrome浏览器为例，在浏览器url栏输入：服务器IP:8890即可，以我的服务器IP为10.10.10.8为例：
看到这个界面的话，恭喜你，你成功配置并启动了Virtuoso服务！
四、数据导入
当然，对于我们使用Virtuoso数据库的开发者、研究者而言，只安装没什么稀奇的。接下来才是重头戏，我们需要把我们自己的数据导入到该数据库，并使用SparQL语句实现数据的查询。
(1) 注意，接下来的数据文件我均使用*.nt文件作为示例，其它RDF文件诸如*.ttl等导入操作相同。 以下为Virtuoso支持的数据格式：
(2) 首先，我们来看一下目前Virtuoso已有哪些Graph：点击可视化界面左上角的conductor按钮，然后使用默认账号用户名：dba 密码：dba进行登录。
(3) 登陆成功后依次点击：Linked Data -> Graphs -> Graphs 即可看到当前数据库中的所有Graphs，可以理解为图数据表，内容如下：
1.可视化界面导入数据
在这个可视化界面，我们可以直接导入数据，但前提是这个数据文件（此处为.nt文件）不能太大，如果太大的话会导入失败，亲测如此！至于多大的文件才叫‘太大’，这个就很玄学。一般来说，几个G大小的文件还是勉强可以导入的，如果更大的话，你还是使用方法2的isql来进行导入吧！
(1) 点击Linked Data -> Quad Store Upload，进入如下页面即可导入数据。需要注意的是，最后一栏的Named Graph IRI你最好改成你需要的名字！（再次导入其它数据文件到这个Graph里面时，只需要保证 Named Graph IRI 一致即可）
比如，我导入了一个.nt文件，在pyCharm中打开该.nt文件内容是这样的：
导入该文件至Virtuoso中，然后将Named Graph IRI命名为http://www.acemap.info，导入完成后，再次进入Linked Data -> Graphs -> Graphs界面，就可以看到自己导入的数据表了，如下：
(2) 使用SparQL语句来查询试试
新开浏览器标签并输入http://10.10.10.8:8890/sparql(再提醒一次，记得把IP改为你自己的服务器IP！这个真的很重要！！！)，会出现以下查询界面：
输入我们刚刚创建的Graph IRI，我的是http://www.acemap.info，SparQL查询语句的话就限制查询100条出来吧，语句就是select * where {?x ?y ?z} LIMIT 100，然后点击下方的Run Query即可，然后就出现了神奇的一幕：
至此，我们就完成了使用可视化界面导入数据的流程。但是，我们可以轻易地发现这种方式的弊端。第一个就是我在前文中所说的，太大的数据文件会导致导入数据失败；第二个，我们需要导入的数据可能是多个.nt数据文件，使用这种方法导入则耗时耗力。那么，为了解决这些问题，我们可以使用接下来的方法，使用isql进行数据的批量导入！
2.命令行中isql语句导入数据
首先是数据，在目录/home/spence/acekg_data_collection/geokg/下，我有一大堆.nt的数据文件，如下图：
回到之前的 linux 命令行中，我们使用了Ctrl-A + Ctrl-D回到主窗口（screen），当前目录为/home/spence/virtuoso/virtuoso-opensource/database
我们现在要做的就是使用isql语句把这些数据全部导入同一个 Virtuoso 数据库的Graph中，命名就为https://www.acekg.cn.
(1)修改virtuoso.ini配置文件
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
vi virtuoso.ini
把这个配置文件中的这一行的共享目录/usr/share/proj改为自己所有数据文件所在的目录，比如我的数据文件目录就是上面的/home/spence/acekg_data_collection/geokg/。
修改前：
修改后：
保存后退出！
然后就是最重要的一步，重新启动virtuoso服务，一定要记住，修改过virtuoso.ini配置文件之后一定要重新启动，否则新的配置不会生效！
重启步骤如下：
1.进入screen vir
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
screen -r vir
2.使用快捷键Ctrl-C关闭virtuoso服务，然后再次启动virtuoso服务即可：
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
virtuoso-t -fd
(2) 下载vsql文件
在当前目录下新建一个vsql文件，名字随意，比如我新建了一个load.vsql文件。前往官网，将下面的代码复制并写入load.vsql文件后保存：
此时load.vsql文件内的内容如下：
(3) 启动isql
！！重要提示！！
如果你的服务器中已经安装了Anaconda环境，你还需要额外进行一步操作，将/home/spence/virtuoso/virtuoso-opensource/bin/目录下的isql重命名为isql-v，这样做的目的是避免和Anaconda中的isql出现冲突；如果你没有装Anaconda环境，那么这一步请忽略，并且后面我使用的isql-v命令你自动替换成isql命令即可！
如下：
重新命名之后，启动isql服务：
spence@main-server-8:~/virtuoso/virtuoso-opensource/database$
isql-v 1111 dba dba
运行load.vsql文件(记住，后面的分号一定要加！)：
SQL>
load load.vsql;
然后会出现以下结果，细心的同学可能会发现输出的日志中不是出现了好几个ERROR吗，不用担心，这不会影响导入过程，接着往下面进行即可！
(4) 导入数据
1）准备数据：
使用以下命令，第一个参数是所有.nt数据文件所在的文件路径；第二个参数是文件，我使用*.nt来通配所有的.nt文件；第三个参数是你想要使用的Graph IRI的名称，这里我使用的是https://www.acekg.cn。
SQL>
ld_dir_all('/home/spence/acekg_data_collection/geokg/', '*.nt', 'https://www.acekg.cn');
如果想要查看当前有哪些数据将要导入Virtuoso，可以使用以下语句查看：
SQL>
SELECT * FROM DB.DBA.LOAD_LIST;
例如我即将导入的数据如下：
2）开始导入：
执行以下语句，将这些数据正式导入Virtuoso数据库：
SQL>
rdf_loader_run();
然后接下来就是漫长的等待时间…
一段时间后，他终于导入完成了，提示如下：
这时在可视化界面也可以看到这个新的Graph了：
查询也可以看到数据：
3) 后续收尾工作
如果此时再次使用语句SELECT * FROM DB.DBA.LOAD_LIST;进行查询时，你会发现已经上传完成的文件仍然在上传列表中：
所以我们需要使用以下语句删除缓冲区数据，避免之后重复上传数据，这一步很重要，即使你退出了isql环境再重新进入，LOAD_LIST里面的数据也不会消失，需要你执行下面的语句才能删除：
SQL>
DELETE FROM DB.DBA.LOAD_LIST;
再次执行SELECT * FROM DB.DBA.LOAD_LIST;进行查询时就发现数据已经从缓冲区删除了。
五、其它
看到这里，其实关于Virtuoso的安装和数据导入差不多就结束了。但是，Virtuoso的内容远不止于此。
1.virtuoso.ini设置
位于database文件夹下的virtuoso.ini文件是关于数据库的设置文件。主要用的就是DirsAllowed 、NumberOfBuffers 和 MaxDirtyBuffers。
- DirsAllowed是设置的允许访问的路径，如果要自己从某一个地方导入一个数据的话，要先把这个数据的位置加入到DirsAllowed里面去。
- NumberOfBuffers 和 MaxDirtyBuffers 设置的是分配给virtuoso的内存和其他系统资源。参照下图。
假如你的的系统内存是16G，就需要把对应的NumberOfBuffers设置为1360000， MaxDirtyBuffers设置为1000000（数值设置宜小不宜大）。
2.References
- [1] http://ws.nju.edu.cn/blog/…
- [2] https://zhuanlan.zhihu.com/…
- [3] http://vos.openlinksw.com/…
- [4] https://vodkazy.cn/2018/…
- [5] https://qa.1r1g.com/sf/…
- [6] https://blog.csdn.net/xiaobao1981/…
- [7] https://www.cnblogs.com/coodream2009/…
- [8] https://bbs.huaweicloud.com/blogs/196507
如果你在安装过程中遇到任何问题，你可以在留言区告诉我，或者通过邮箱联系我，我会较快回复。
tangguo1280@163.com
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