利用matlab的SPM12功能核磁共振成像数据处理

2.3 Segmentation图像分割
第一步：Highlight the “Volumes” field and then select the subject’s registered anatomical image eg.
sM00223_002.img.
第二步：Highlight “Save Bias Corrected” and select “Save Bias Corrected”.
第三步：Highlight “Deformation Fields” the bottom of the list and select “Forward”.
第四步：Save the job file as segment.mat and then press RUN.
SPM将会利用默认设置的组织概率图分割结构像，所利用的原理详看文献

J. Ashburner and K.J. Friston. Computing average shaped tissue probability templates. NeuroImage, 45(2):333–341, 2008

经过图像分割后，将会得到灰质图和白质图像，利用CheckReg按钮可以观察图像与结构像的差距，

SPM will also write a deformation field，file y_sM00223_002.nii。

2.4 Normalise（配置到某个大脑模板上）
Select Normalise (Write) from the Normalise pulldown menu。然后按照如下步骤操作即可，

SPM将空间规范化后的数据写进文件夹dummy中,这些文件名字有w开头。
If you wish to superimpose a subject’s functional activations on their own anatomy， you will also need to apply the spatial normalisation parameters to their (bias-corrected) anatomical image
按照如下操作即可。

同样可以用利用CheckReg按钮可以观察图像与初始的结构像的差距。

2.5 Smoothing（平滑处理）
Press the Smooth button。然后按如下步骤操作即可。

然后利用CheckReg按钮可以比较平滑之前的数据和平滑之后的数据的区别。

经过以上几个步骤后数据预处理部分已经完成，接下来就要进行统计分析了。

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