在SimpleITK形式下，将RAS和IJK坐标系互转

参考文章slicer软件中RAS转换为像素坐标方法

import SimpleITK as sitk
import numpy as np            itkimage=sitk.ReadImage("MRBrainTumor1.nrrd")#先转成list,再由list转为numpy
numpyOrigin = np.array(list(itkimage.GetOrigin()))
numpyOrigin[0]=-numpyOrigin[0]
numpyOrigin[1]=-numpyOrigin[1]numpySpacing= np.array(list(itkimage.GetSpacing()))numpyDirection= np.array(list(itkimage.GetDirection())).reshape(3,3)
numpyDirection[0,0]=-numpyDirection[0,0]
numpyDirection[1,1]=-numpyDirection[1,1]def RAS_to_IJK(ras, origin, direction, spacing):ras = ras - originras = np.matmul(np.linalg.inv(direction), ras)ijk = ras / spacingreturn ijkdef IJK_to_RAS(ijk, origin, direction, spacing):ras = ijk * spacingras = np.matmul(direction, ras)ras = ras + originreturn ras

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