生信技能04 - 生信分析所需致病SNP位点Excel文件制作教程

致病SNP位点Excel文件制作教程

在生信分析项目中，有遗传相关的项目会涉及到SNP位点的查找，将该SNP位点文件作为程序输入文件，本文将介绍如果通过NCBI查看目标基因的致病SNP位点，并制作成可用于后续程序解析的格式。

1. NCBI查找并下载致病SNP位点数据

step 1: 打开浏览器，输入https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，打开NCBI网站，切换搜索栏位为Gene，在输入栏输入要检索的基因名(Symbol ID)，点击Search，以检索COL4A5基因为例。

step 2 : 确认搜索结果为Homo sapiens (huamn)，点击COL4A5 - collagen type IV alpha 5 chain

step 3 : 下翻基因的详细结果页面至Variation，点击See SNP Geneview Report

生信技能04 - 生信分析所需致病SNP位点Excel文件制作教程相关推荐

生信技能17 - 获取外显子和内含子位置坐标及编码序列
对DNA序列的操作是生信分析编程中经常涉及的内容,以下为获取外显子(exon)和内含子(intron)的位置及编码序列函数,不知道什么是exon和intron的可以看我下面这篇文章: 生信技能9 - ...
9个专业分享生信技能的公众号
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题,但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情. 学习生信从来就不是一个简单的事,需要做好持久战的心理准备. 在此推荐一波生信 ...
这是入门生信，学习生信分析思路和数据可视化的首选？
封面来源:https://www.zhihu.com/question/304747766 常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型,其实验方法成熟,花费较低,是大部分CNS必备的技术,以后 ...
【生信】全基因组关联分析（GWAS）原理
[生信]全基因组关联分析(GWAS)原理文章的文字/图片/代码部分/全部来源网络或学术论文,文章会持续修缮更新,仅供大家学习使用. 目录 [生信]全基因组关联分析(GWAS) 1.前提知识介绍 1. ...
生信步骤|转录组测序上游分析：hisat2+samtools+stringtie
转录组分析在当下研究功能基因组领域十分常用.相关软件组合种类也十分丰富,本文采用了hisat2+samtools+stringtie策略从转录组数据中挖掘差异表达基因.在这里小编整理了一下此套组合的执 ...
生信c语言,生信人的R使用
接下来介绍R语言: [生信技能树]生信人应该这样学R语言 R语言在你开始R之旅前,建议你看看下面这两个 1. 介绍R语言及Rstudio 了解R,Rstudio及R包;安装的包在packages中检 ...
r语言转录本结构及丰度_生信实操|一个生信素人的上道经验分享转录组测序（绘图篇）...
转录组测序技术(RNA-seq)作为目前二代测序领域最普遍的技术手段,自从转录组测序问世以来,已经开发了数百种分析工具.根据转录组分析内容可大致将其分析流程分为比对,转录本组装,差异表达分析和差异基因 ...
【生信MOOC】生信数据库2
[生信MOOC]生信数据库2 文章的文字/图片/代码部分/全部来源网络或学术论文,文章会持续修缮更新,仅供大家学习使用. 目录 [生信MOOC]生信数据库2 1.一级蛋白质序列数据库:UniProt ...
ABV指标与通达信的主力进出指标分析
李雨青老师在中国教育频道强调的ABV指标与通达信的主力进出指标分析主力进出指标原码: VAR1:=(CLOSE+LOW+HIGH)/3; VAR2:=SUM(((VAR1-REF(LOW,1))- ...

生信技能04 - 生信分析所需致病SNP位点Excel文件制作教程

致病SNP位点Excel文件制作教程

1. NCBI查找并下载致病SNP位点数据

生信技能04 - 生信分析所需致病SNP位点Excel文件制作教程相关推荐

最新文章

热门文章