Python的Mann-Kendall非参数检验和计算Hurst指数
Mann-Kendall 检验法简称为 M-K 法, 是一种非参数统计检验方法, 可适用于不具有正态分布特征变量的趋势分析[38]。假定X1,X2,...Xn为时间序列变量[1],n为时间序列的长度,M-K 法定义统计量S为
其中
式中, xj、xk 分别为第j、k年对应的观测值,且j< k。
标准化的检验统计量Z为
当n≥10时,统计量S近似服从正态分布,在不考虑序列中等值数据点的情况下,其均值E(S)=0 方差
D(S)=n(n-1)(2n+5)/18 。[2]
D(S)的计算论文中还有另外一种公式,D(S)和Var(S)均为S的方差。
g为将观测数据按照相同的元素进行分组,共有多少组g就是多少,tp为每一组元素个个数。
例如一组数据(1,1,2,2,2,4,4,4,4,4,7,7,7,8,9),其中可以分为(元素,个数):(1,2个)(2:3个)(4,5个)(7,3个)(8,1个)(9,1个),则g为6,tp分别为2,3,5,3,1,1。依次带入再求和即可。当tp为1的时候tp-1为0,因此可以不考虑只出现一次的数,只考虑出现过多次的。如果一组数据每个数只出现过一次,那么求和部分的结果为0,方差只剩下n(n-1)(2n+5)/18。(参考文献[3])
Hurst指数根据R/S 分析求得,R/S 分析即重标极差分析,是一种基于长程相关思想的时间序列分析方法。这种方法由 H. E. Hurst 于1965年最先提出,后来伴随着非线性理论的发展而成长起来。R/S 分析具体过程参见地理数学方法[4]。
(1)计算S
import numpy as np
def s(inputdata):
#输入numpy数组n=inputdata.shape[0]t=0for i in np.arange(n):if i <=(n - 1):for j in np.arange(i+1,n):if inputdata[j]> inputdata[i]:t=t+1elif inputdata[j]< inputdata[i]:t=t-1else:t=treturn t
(2)计算Z
data=rd(r'D_S.tif')
#data为S,这里是针对一个单波段tif图像
n=10
var=n(n-1)(2n+5)/18
#n为时间序列的长度;var为方差
sv=np.sqrt(var)
#sv为标准差
r,c=data.shape
z=np.zeros(data.shape)
#由于时间久远,只用了for循环处理较慢,可用numpy矩阵运算效率更高
for i in range(r):for j in range(c):if data[i][j]>0:z[i][j]=(data[i][j]-1)/svelif data[i][j]<0:z[i][j]=(data[i][j]+1)/sv
(3)计算beta
def beta(inputdata):n=inputdata.shape[0]t=[]for i in np.arange(n):if i <=(n - 1):for j in np.arange(i+1,n):t.append((inputdata[j]-inputdata[i])/((j-i)*1.0))return np.median(t)
(4)计算Hurst指数
import numpy as np
def Hurst(x):#x为numpy数组n=x.shape[0]t=np.zeros(n-1) #t为时间序列的差分for i in range(n-1):t[i]=x[i+1]-x[i]mt=np.zeros(n-1) #mt为均值序列,i为索引,i+1表示序列从1开始for i in range(n-1):mt[i]=np.sum(t[0:i+1])/(i+1)#Step3累积离差和极差,r为极差r=[]for i in np.arange(1,n): #i为taocha=[]for j in np.arange(1,i+1):if i==1:cha.append(t[j-1]-mt[i-1])if i>1:if j ==1:cha.append(t[j-1]-mt[i-1])if j>1:cha.append(cha[j-2]+t[j-1]-mt[i-1]) r.append(np.max(cha)-np.min(cha))s=[]for i in np.arange(1,n):ss=[]for j in np.arange(1,i+1):ss.append((t[j-1]-mt[i-1])**2)s.append(np.sqrt(np.sum(ss)/i))r=np.array(r)s=np.array(s)xdata=np.log(np.arange(2,n))ydata=np.log(r[1:]/s[1:])h,b= np.polyfit(xdata,ydata, 1)return h
参考文献:
[1] 常远勇,侯西勇,毋亭,等.1998~2010年全球中低纬度降水时空特征分析[J].水科学进展,2012,23(4):475-484.
[2] 章诞武,丛振涛,倪广恒.基于中国气象资料的趋势检验方法对比分析[J].水科学进展,2013,24(4):490-496.
[3] https://www.researchgate.net/profile/Jyotsna_Singh15/post/Will_anyone_help_me_in_interpreting_the_result_of_mann-kendall_test_statistics_and_sens_slope_estimator2/attachment/59d6246279197b8077982b88/AS%3A312627941576704%401451547717495/download/Mann+Kendall+Analysis.pdf
[4] 陈彦光.地理数学方法:基础和应用[M].北京:科学出版社,2011.
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