凌恩生物提供各类物种的线粒体DNA的富集和抽提,从前期样本制备到后期生物信息分析,都致力于为客户提供最专业的服务。

线粒体相关介绍

线粒体(mitochondrion,mtDNA)是一种存在于大多数真核生物中的由两层膜包被的细胞器,是细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所。大多数真核细胞或多或少都拥有线粒体,但它们各自拥有的线粒体在大小、数量及外观等方面上都有所不同。

不同生物线粒体的结构特点:

植物:300~1000kb,基因组内有很多重复序列,基因结构复杂,编码区占比低,是目前组装和注释难度最高的小基因组

藻线:基本在100kb以下,基因组重复序列少,基因区结构较简单

真菌:比较小,常见的在30~120kb,物种间序列变异较大,基因数不多但结构较为复杂

动物:常见的大小在15~16kb,基因排列紧凑,会出现部分基因区的重叠,没有或很少的基因间隔序列

常见的圈图如下:

真菌线粒体圈图例图.pdf

植物线粒体圈图例图.png

动物线粒体圈图例图.png

分析流程

公司优势及项目经验

公司已经完成及在线的线粒体已经超过80个,动物和植物线粒体较多;其中96%以上的样本组装到完成图水平。

统计目前已完成及在线的线粒体物种分布,植物线粒体分布于5种不同的科,主要物种如水稻、玉米、胡萝卜、棉花、小麦等;动物线粒体分布于15种不同的科,如一些海产品(比如鱼、海胆)和鸟类、软体动物等。

藻类线粒体项目的物种分布主要是金球藻、红球藻和其他一些水藻。

项目类型 物种 拉丁名
植物线粒体 藻科 Chlorellaceae;Palmellaceae
黍亚科 Panicoideae;Panicodae
禾本科 Poaceae;Gramineae
豆科 Fabaceae;Leguminosae
伞形科 Apiaceae;Umbelliferae
藜科 Chenopodiaceae
项目类型 物种 拉丁名
动物线粒体 蚶科 Arcidae
蛔科 Ascaridae
鱼类 Fish
石鳖 Chiton
竹鼠科 Rhizomyidae
鸠鸽科 Columbidae
天牛科 Cerambycidae
笠贝科 Acmaeidae
水母科 Rhizostoidae
甲壳类 Crustaceans
绦虫类 Cestoda
海胆类 Echinoidea
刺鲀科 Diodontidae
蜂类 Bees
线虫类 Nematode
书虱科 Liposcelididae

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