Shiny平台构建与R包开发

Introduction

在数据库网页搭建教程中已经提到，数据分析决策平台的搭建十分重要。数据库网页是数据分析决策平台的重要表现形式之一，能够很好地将大量数据或其分析结果公开展示，并能提供数据下载、统计分析以及可视化等服务，目前已在多个领域中得到广泛应用。然而，基于MySQL+PHP及w3c开发的数据库网页难以承载较大的运算量，也难以解决代码编写复杂的问题。

RShiny提供了了一种不同的数据分析决策模式。基于RShiny框架，用户可以在R/RStudio环境中调用RShiny，利用Shiny生成的图形用户界面接口生成的网页中进行互动式数据分析。对用户而言，图形用户界面的呈现极大地减少了代码开发量，使其能通过简单的操作完成复杂的数据分析任务。因而，基于Shiny的数据分析包也越来越受到数据分析人员的欢迎。典型的案例是用文献计量学分析的bibliometrix包。

本教程希望引导读者利用RShiny完整地开发属于自己的数据分析包，并分享制作R包的一般流程和常见错误。本教程假定读者已有HTML+CSS+JS网页设计的基础，以更好地理解Shiny的工作机制，尽管Shiny框架的开发并不一定需要这些知识。

Outline

Shiny平台构建与R包开发（一）——ui布局
Shiny平台构建与R包开发（二）——数据输入
Shiny平台构建与R包开发（三）——数据输出
Shiny平台构建与R包开发（四）——按钮与响应事件
Shiny平台构建与R包开发（五）——ui美化
Shiny平台构建与R包开发（六）——R包开发与发布
Shiny平台构建与R包开发（七）——Shiny APP部署

Example

本教程采用的案例为Expmeasure包。要下载并安装Expmeasure包，请在R或Rstudio中运行以下代码：

install.packages("devtools") # only required if you do not have this package
library(devtools)
install_github("IGEM-ZJU-2021/expmeasure")

安装Expmeasure包将安装大量依赖包，因而安装过程需要等待一段时间。安装完成后，继续运行以下代码，即可进入Expmeasure包的Shiny界面：

library(expmeasure)
expmeasure()

您将看到Expmeasure软件（1.0版本）的主页界面：

图1 Expmeasure主页界面

在Data页面，用户可以上传.csv格式文件的数据，数据应遵从标准数据库格式。在其他页面中，用户可以采用具体的分析方法对上传到Shiny中的数据进行进一步统计分析和可视化。Expmeausre软件的使用手册与测试数据将会于2021年10月24日前后在以下网页中公布（目前网页中还没有任何内容）：
https://2021.igem.org/Team:ZJU-China/Software
目前该包的各项功能和ui设计依然在不断完善。

欢迎感兴趣的同行朋友们批评指正。
联系邮箱：hrwu_ecology@163.com