R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

R语言于生物学分析中的应用越来越广泛，在其他领域的统计绘图应用中也有很强大的功能。因此，从零开始学习R, 既为自己留一个总结的电子笔记，也想能够和大家一起交流!

The R Programming Language 于1980年左右的诞生于新西兰奥克兰大学，由Robert Gentleman和Ross Ihaka及其他志愿人员开发了一个R系统，属于S语言的一个分支，用来用来进行数据探索、统计分析和作图。

学习R的第一步就是下载一个最新版本的R。R是开源软件，https://www.r-project.org/可从官方网站进入，选择CRAN镜像源下载并安装。

R自身的界面过于简单，应用起来不够得心应手。R studio便很好的解决了这个问题。作为最方便的R语言操作平台，也可以从官方网站下载到免费版本。

RStudio​rstudio.com

依次下载安装好R 和R studio， 就可以打开使用，开始R语言的旅程啦！

Rstudio界面如下，新建一个R script 的文件

界面大概分为四个区域

1. source区，文件打开的区域。查看文件时会显示于该位置。此区域通常用于代码的打开和书写，特别是重要的想要保存的代码，可以在此区域写作，顺手保存，而后点击右上角的run图标进行运行。

2. 主要操作区，console为发送代码指令的平台。于>后开始输入脚本，回车便可开始执行。但此区域的脚本不会得以保存，关闭程序后会自动清空。

3.environment， history and connection。 应用最多的environment， 可用于显示在此代码文件中存在或新建的所有对象，包括（list， value，function 等），并且可用于导入已有数据。

4.files可见目标文件夹及相应文件数目。plots用于显示R语言所绘制的图形。packages选项内，通过点击选择框，可自行添加罗列的R语言包，以扩充R的功能，或根据目的方便操作。help即帮助选项，R的帮助功能很强大，在使用过程中可以通过搜索功能不断学习。

强调在最前面：R 和R studio使用时，代码中一定不能出现中文（标点符号，括号是最容易造成error的原因之一）

（一）R的基础操作 Navigating the basics

R的REPL （Read-Evaluate-Print-Loop）R语言写入指令并执行，R进行运算后，会于下一行返回相应的结果，并期待下一个指令，上述成为其REPL循环。

R的基本逻辑与语句的构成部分：

名词（变量，对象）；动词（函数）；条件（如果if ）；布尔逻辑（且 and/ 或 or/ 非 not）

跟说一句话发布一句指令相同，R的语句也由上述因素构成。在开始输入脚本之前，要先根据自己的目的，在脑海中形成伪代码（思维过程），然后使用计算机语言翻译。

例如： 如果（if）是情况a，求1,2,3,4,5（对象） 的和（函数）；如果是情况b，求1,2,3,4,5的平均数；如果既不是情况a，也不是情况b（布尔逻辑），求1,2,3,4,5的乘积。

1. 简单运算与注释

简单的数值运算，可以直接输入，回车的到结果

注释可以使用#。注释的部分不会纳入运行，仅做标记。在运行到较大较复杂的脚本时，注释可以很清晰的实现提示、解释、强调等作用。

2. 对象与赋值 value（值）assigned（赋予）variables（变量，对象）

2.1 变量的种类 变量有很多种类，值也根据变量的种类而不同。

常见的变量有以下种类： 数值型 numeric，文字字符型 string：character， 表格data.frame， list数据，逻辑数据logi，向量vector，矩阵 matrix，函数function

2.2 建立一个变量（对象），并赋予一定的值，称为赋值（assignment）

上述我们分别建立了变量（对象）

x（数值型） 赋值（<-）5

y （字符型）赋值（<-）"hello"

index（逻辑数据） 赋值（<-）c(True,True,False)

v（元素为数据的向量）赋值（<-）c(1,2,3,4,3,2,1,0)

w （元素为字符的向量）赋值(<-) c("1","2","3")

list1（list类型数据）赋值(<-) list(x,y,v,w)

f1（函数）赋值(<-) function(x) 具体函数内容{x^2+5}

同时导入表格数据a 和 矩阵数据asel

建立完成后，我们可以在environment中可以看到一一罗列

2.3 对象的基本信息

类型（class） 长度（length）维度（dimension）其他。。。

举例对象x

使用函数class(x) 可展示其类型， length(x) 与dim(x) 可展示其长度与维度