课程名称：Writing in the Sciences
课程地址：https://www.coursera.org/learn/sciwrite/home/welcome
所属学校：Stanford University

Unit 4:

4.1 More paragraph practice

In assessing the quality of an instrument we distinguish three quality domains, i.e. reliability, validity, and responsiveness. Each domain contains one or more measurement properties. The domain reliability contains three measurement properties: internal consistency, reliability, and measurement error. The domain validity also contains three measurement properties: content validity, construct validity, and criterion validity. The domain responsiveness contains only one measurement property, which is also called responsiveness. The term and definition of the domain and measurement property responsiveness are actually the same, but they are distinguished in the taxonomy for reasons of clarity. Some measurement properties contain one or more aspects, that were defined separately: Content validity includes face validity, and construct validity include structural validity, hypotheses testing, and cross-cultural validity.

Domain	Measurement Property	Aspect
Reliability	consistency
	reliability
	measurement error
Validity	criterion validity
	content validity	face validity
	construct validity	structural validity
		hypothesis testing
		cross-cultural validity
Responsiveness	responsiveness

修改之后：

The church’s record-keeping system and its high level of accuracy has been previously reported (2). Briefly, the church creates and maintains a church record for each individual who is baptized into the church. These records are created at the congregation level at the time of baptism and then forwarded to the general church level where the membership record is added to the church membership database. These records contain minimal information including name, date of birth, parents’ names, dates of church ordinances, and current address. Each congregation has a lay membership clerk who is responsible for updating the membership records for the members of the congregation. Such updates would include dates of ordinances received after baptism (e.g., priesthood ordination or marriage), name of spouse when a member marries, change of current address and date of death.

While the accuracy of the church record is dependent upon lay clerks within each congregation, each member has an opportunity to review their membership record once a year to check it for accuracy. For this reason and because the church emphasizes accurate record keeping, the information available from the church records is quite reliable, especially for members who are actively involved in the church. When a member dies and the clerk reports his/her death to the Church Membership Council, the membership record is updated and then archived in the church’s deceased membership file.

修改之后：

Previous studies have consistently reported increased risk of subsequent drug use associated with conduct problems and antisocial behavior in childhood (1-5), and an association of drug dependence with conduct problems was found in a general survey of young adults (9). Furthermore, long-term relationships between aggressive, unconventional, and impulsive behaviors have also been found with drug use involvement generally (10-12). /实际上有两个想法，所以可以从此分段/ However, different pathways between early childhood misbehavior and drug involvement may exist. Psychiatric symptoms and cognitive disabilities may be manifest as aggressive behaviors and drug use may be a response to impulsive tendencies that often co-occur with aggression or misbehavior. Distress and failure to adopt responsible conventional roles and behaviors may be important mediators linking childhood misbehavior to late drug dependence (13,14).

4.2 Overview of the writing process

科研论文写作步骤：

Prewriting：
- collect，synthesis，and organize information
- brainstorm take-home messages
- work out ideas away from the computer
- develop a road map/outline
Writing the first draft：
- putting your facts and ideas together in organized prose
Revision：
- read your work out loud
- get rid of clutter
- do a verb check
- do an organizational review
- get feedback from others
- get editing help

在写初稿时，不要过于专注于细节，而要顾全大局，把核心思想表达清楚，然后在修改的时候再逐渐修改细节。建议在以上三个步骤中的花费时间比例：

Prewriting（70%）
Writing the first draft（10%）
Revision（20%）

4.3 The pre-writing step

首先收集并阅读大量的论文，并在阅读时提取其中的关键信息（例如统计数据，细节，想法等可能在自己的论文中将会用到的一些信息），同时将这些信息记录到word中，最后移动整理这些信息，使其更有逻辑和条理，以备使用。

很多人认为把时间花费在组织信息上是在浪费时间，实际上并非如此。如果前期工作做得充分，者将会为将来的写作节省很多时间，并且文章更有条理。

关于论文的idea，可以在走路时，排队时，看文章时等放松的氛围中思考相关的课题，然后及时的记录下来。

在写相关工作部分时，针对关键证据和引用要会建立并使用线路图。论文的其他部分也适用。

关于论文内容的组织，有几个小技巧：

对相似的思想应该进行分组整理。如果有多个段落都在讲同一件事，应该将他们归为一个段落，或者是彼此相邻的几个段落。
不同段落讨论相同主题时，应该将他们移动到一起，以减少重复。
在讨论争议的论点时，应该将赞成的论点放在首位，然后再讨论反对的论点。

4.4 The writing step

关于初稿写作有以下建议：

不要成为完美主义者！
初稿的唯一目的是：用完整的句子和顺序记录我的想法，只需要语法完整并在正确的位置。
重点关注重要的信息和逻辑组织，不要担心句子级别的组织。

第一个例子：

第二个例子：

4.5: Revision

read your work out loud
get rid of clutter
do a verb check
do an organizational review
get feedback from others
get editing help

句子级的审查注意以下几点：

组织级别的审查注意：

用一个短语或者句子标记每个段落的总结要点
不可避免地会发现一些表达相同意思的段落，现在需要将这些段落聚集在一起

4.6: Checklist for the final draft

有以下三点需要检查：

一致性（consistency）：即没有自相矛盾的地方
数值一致性：
- 保证摘要中的数值与文中数值一致
- 表和图中的数值一致
参考文献一致性：
- 作者误解或夸大了原始文献的发现
- 引用了二次文献的结论而非原始文献的结论（即在引用的结论是被引文献从其它文献引用的结论）
- 引文标号搞错

Unit 5

缓解论文写作焦虑和恐惧，让论文写作变得更容易的一些技巧：

将写作任务分为更小更具体的目标，比如：
- 今天写400个单词
- 今天写discussion部分内的两个段落
- …

老师推荐的论文草稿写作顺序：

Tables and Figures
Results
Methods
Introduction
Discussion
Abstract

5.1: Tables and Figures

表格和图片不能随意放置。因为编辑，审稿人，读者可能会首先看文章的标题，摘要，表格和图片！这意味着图片和表格应该能够独立存在，能分别表达一个要点，能够完整说明一个问题，读者无需阅读正文部分。注意，在图片和表格中也需要定义缩略词。有以下两点需要注意：

使用最少的图片和表格来说明问题，像写散文一样，表达要简明扼要。
不要在图片和表格中重复相同的数据。

使用图片的目的和作用：

图片更有视觉冲击力
能够展示趋势和模式
能够快速展示某一个要点
能够展示所有要点，例如展示所有数据分布或范围
突出强调最重要的实验结果

使用表格的目的和作用：

表格需要给出精确的数值
展示许多数值和变量

表格标题的注意事项：

每个标题都讲述某一个故事，并能够简要介绍这个故事
表格的列名应该与正文中的关键术语保持一致
标题要简明扼要

表格脚注的注意事项：

表格格式的注意事项：

表格格式要遵循已发表论文的格式，不要重新造轮子！例如一些期刊论文的写作指导：
- Roman or Arabic numbers
- centered or flush left table number，title ，column，headings and data
- capital letters and italics
- the placement of footnotes
- the type of footnote symbols
一些期刊要求三线制表格，有些会更进一步要求用一行灰色一行白色来进行区分显示
- 注意要加单位
- 注意保留有意义的小数位数，例如年龄不需要小数
- 移除不必要的列

图片的类型：

Primary evidence
- electron micrographs，gels，photographs，pathology slides，X-rays，etc。
- indicates data quality
- seeing is believing
Graphs
- line graphs，bar graphs，scatter graphs，histograms，boxplots，etc。
Drawings and diagrams
- illustrate an experimental set-up or work-flow
- indicate flow of participants
- illustrate cause and effect relationships or cycles
- give a hypothetical model
- represent microscopic particles or microorganisms as cartoon

图片图例（legend）的可能需要包含以下部分：

Brief title
Essential experimental details
Definitions of symbols or line/bar patterns
Explanation of panels（A，B，C，D，etc）
Statistical information（test used，p-values）

注意图片可以单独存在，因为合格的图片图例可以完整地讲述一个故事。例如：

Graphs的类型及注意事项：

line graphs：展示变量（例如年龄，剂量）的变化趋势
scatter plots：展示两个变量之间的关系，能够展示所有数据
bar plots：展示数据的统计属性
individual-value bar graphs：
histograms：
box plots：
survival curves：

一个比较好的图片：

Diagrams and Drawings 的注意事项：

5.2: Results

首先需要注意 Results != Raw Data 。结果部分不要详尽地复述表格或图片中的内容，而是要重点总结这些数据展示了哪些内容，以实现更高层次的表达：

指出简单的关系
描述图片的趋势
引用提供数据支持的图片或者表格

正确示范：

可以看出内容非常简洁，用一句话概括了表格的内容。以下是一个错误的例子：

如何进行修改呢？首先需要让读者明白这是一个描述性的表格，所以不要浪费时间来说显而易见的事情（例如照搬文中的数值），以下修改通过更高视角来总结表格的内容（没有设计具体的数字，关键是指出这两个群体在高层次上的不同）：

结果部分（关于你发现了什么，而不是你做了什么）写作的建议：

如果结果很多很复杂，如果有必要的话，可以考虑将结果分为带有信息性标题的小节。
应该充分总结补充图表的内容，而非一味的重复图标中的内容。
- 给定图片中不可获取的精确值
- 如果表格中给定了精确值，则可以描述百分比变化或者差异
只重复或强调最重要的数值
不要忘记对照组与实验组的结果一样重要
不要将result部分与discussion部分的内容混淆，结果部分是关于数据所展示的内容，讨论部分是关于数据的含义。因此在结果部分描述这些发现的基本内容，然后将这些发现的解释放到讨论部分。

关于动词时态的选择：

对于已完成的事情（例如实验和分析），使用过去时态。例如：
- We found that…
- The average reaction time was…
- Women were more likely to…
- Men smoked more cigarettes than…
如果讨论继续为真（阅读论文是仍然是正确的）的断言（例如图表或数据展示的内容），则这些陈述属于现在时态。例如：
- Figure 1 shows…
- The findings confirm…
- The data suggest…
- We believe that this shows…
一个正确的示例：
使用主动语态：因为主动语态更生动，并且更容易阅读！
- 注意，不光只有人（例如we）可以做主语，其它的模型或者数据等也可以做主语

5.3: Practice writing results

The majority of runners ran during pregnancy (70.0%, 77/110), with 62.7% running during the first trimester, 51.8% during the second trimester, and fewer than one third (30.9%) during the third trimester (Table 2). From the 77 women who ran during pregnancy, we observed the average weekly mileage during pregnancy for those who ran to be 20.3 ± 9.3 miles. Average running intensity was reported to be 47.9% ± 21.0% as a percent of non-pregnant running effort. A small number (3.9%, 3/77) reported sustaining a running injury while pregnant. About a quarter (24.8%) waited 5-7 weeks to resume running post-partum. A small fraction (5.7%) resumed running less than a week after giving birth. Some women (11.4%) waited more than six months post-partum to resume running.

不需要详尽地将表中所有的数字都写到文中，而只需要挑几个有意义的数据进行强调即可。例如似乎有三分之一的女性在妊娠晚期仍在跑步等等。修改之后：

5.4: Methods and Materials

该部分所要表达的内容：

应该能够清楚地概述所做的工作
提供足够的信息以便其他人能够复现该研究
应该是完整但容易阅读的
- 通过副标题分解成不同的部分
- 引用常用方法的参考而不是深入研究
- 使用流程图或表格描绘所提出的方法
该部分可以自由使用被动语态和行业黑话

该部分的写作标准（由Clinical Chemistry 的 Annesley TM 提供）可以参考以下写作方法：

该部分所包含的部分：

Materials
- Drugs，buffers，chemicals，gases，reagents，cell lines，etc。
Participants/subjects
- Animal
- Humans
Experimetal protocol/study design
Measurements
- How were the dependent and independent variables measured
  - instruments(telescope, microspcope, weighing scale, etc)
Analyses

使读者容易阅读的小技巧1——使用副标题将内容分为不同的部分，例如：

通过这样划分，读者只需要跳转到其想要关注的某些小节即可，而不必通篇阅读该部分。

使读者容易阅读的小技巧2——引用已有的方法，而不需要深入研究（假设读者已经熟悉该方法），这个技巧非常有效，因为作者不需要阅读其他地方已经有的实验细节。

使读者容易阅读的小技巧3——使用流程图。

动词时态的选择：与result部分完全相同！

被动语态与主动语态的使用：

一个例子：

5.5: Introduction

一般来说引言部分有3个自然段，推荐2-5个自然段。

引言部分不应该过长，无需对当前的主题进行详尽的调查，只需要将精力集中在你研究的特定的假设或者目标即可。图片来源：source。

最好的写作顺序是：从已知的信息开始，然后是与已有研究的差距及其局限性，接着进入研究的特定问题或者目标或者假设，最后提出本文的解决方案，并说明本文的研究如何填补已有研究的空白和局限性。可以将以上内容分为以下3个自然段：

引言写作的要点：

保持自然段的简明扼要
尝试为一般读者写作，即行文要做到：清晰，简洁，非技术性（技术性的讨论放到methods部分）
按照上文提到的写作顺序，循序渐进进行写作
一定要写明你的研究填补了已有研究的哪些空白
一定要说明你研究的问题/目标/假设
- 例如 we asked whetehr; outr hypothesis was; we tested the hypothesis that; out aims were
无需使用实验结果对提出的问题进行解答
最后，在更高的层次对已有研究进行总结（谁研究了什么，但是其问题是什么），告诉读者以前广泛的研究有哪些

第一个例子：

第一段第一句表述已知信息
第一段第二句表述未知信息
第一段第三句表述已知信息
第一段第四句表述未知信息
第一段最后一句话表述先前研究的局限性
第二段提出本文的解决方案

第二个例子：

第一段第一句表述已知信息
第一段第二句表述位置信息或者研究问题
第一段第三局表述已有研究的简短综述
第二段表述先前研究的局限性
第三段表述本文的研究

5.6: Discussion

讨论部分是论文中自由度最高的部分。
讨论部分写作要点：

讨论部分写作模板：

讨论部分写作建议：

讨论部分的时态问题：

过去时：当提及到研究细节，结果，分析和背景研究时，使用过去时。
- we found that
- miller et al. found
- subject may have experienced
现在时：当论述数据所暗示的内容时，使用现在时。
- the greater weight loss suggests
- the explanationfor this difference is not clear.

5.7: Abstract

摘要写作就是从论文中提取片段，并组合的过程。

概述整个论文
只要突出每个部分的关键
单词数量限制在100-300个单词
与表格和图像一样，摘要必须能够独立成文

建议在写完论文之后再写摘要。

摘要写作流程：

首先使用一句话阐述背景
然后明确说明将要研究的问题或者目的
- we asked whether
- we hypothesized that
- etc
接下来快速总结你所做的实验
然后给出几个关键结果和几个重要数字
之后是一个简短的结论来回答所提出的问题或在研究中测试的假设
最后要有一些暗示，推断或者推荐，让读者明白为什么这项研究很重要（与现实世界的相关性）。

摘要的例子：

Unit 6

6.1: Plagiarism

在论文写作中剽窃的定义：

将他人的研究当做自己的成果，这包括：
- 剪切和粘贴他人研究的句子甚至是段落
- 轻微的重写或者重新排列别人的单词
- 直接从像维基百科之类的网站摘抄内容

如果需要他人的研究作为辅证，应该遵循引文格式，以下是一个剽窃的例子：

当表述其他研究的工作时，需要做到：

必须足够理解这些工作，直至能够用自己的话来表达，这个过程中可能需要查阅大量的资料，在查阅的过程中可以将那些辅助理解的片段或句子剪切下来，并注明出处。这样在以后写作的时候就知道哪些不是自己的成果。
从你的记忆开始写作，永远不要在其他人的基础上进行洗稿。
得出自己的结论，并就该主题提出自己的想法。
不要只模仿原作者的句子结构或只重新排列原作者的话。
当两句话重复的单词多于7个时，基本可以认为是抄袭。当不确定自己写的句子是否为抄袭时，可以将句子加上引号，用谷歌进行搜索，查看检索结果。

自我抄袭的定义：

将自己已发表的论文数据直接复制到正在写作的论文，这包括：
- 复制或者只是轻微修改自己先签发表额论文
- 对已发表论文的数据增加新的数据，并提出新的结果
- 论文中某些部分（method部分）存在一些重复的文本是可以接受的，但是大量重复就是抄袭
- 如果crosscheck的查重率超过 6%-23% 则将会被直接拒稿

6.2: Authorship

作者署名权有两个问题必须回答

谁将获得作者署名权

任何列出的作者应该对论文的内容负公共责任

作者的顺序排列问题

顺序意味着作者的相对贡献
第一位作者通常是学生，最后一位作者通常是资深作者或者研究团队的负责人
论文可以有共同一作
为了公平起见，应该将位于第一位作者和最后一位作者之间的的作者按照相对贡献大小进行排列，如果不清楚贡献的大小，可以按照名字的字母顺序排列
大型工作组可以作为一个组进行引用

致谢（Acknowledgements）部分

写明资助的来源
这里也是感谢那些提供帮助但是不足以（或者不同意）作为论文作者存在的科研人员的地方
关于幽灵/名誉作者的问题：幽灵作者指的是企业聘请的专业专家撰写了论文，但是并未出现在论文的作者署名中，这种情况在医学领域比较常见。

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