另一种blast2go的思路

blast2GO是用序列相似性得到go的信息，而网上很多软件要么针对某个蛋白的，要么就是只能网上运行的，还有就是只有windows的，烦- -

但如果用名字对应会怎么样，尝试了一番记录如下：

我们的序列先进行blast Nr库得到的是比对的蛋白序列，名字有gi号和refseq号；

NCBI FTP里面有个gene2go的文件，发现是geneid对应go号；

又从FTP里面发现了gene2refseq文件，是geneid对应gi号；

好了，由此我们可以把这三者进行了串联，结果发现了350多条对应关系，而blast2go的结果有303，\(^o^)/~！

但是我将两者取了交集之后，发现只有5个！只有5个！只有5个！！！瞬间伐开心。。。

所以我在想是不是有几种情况要考虑：

首先是过滤，我们blast的参数都是设定好的，当然可以过滤一部分，程序里面取的是在数据库里面有的且最好的，但blast2go肯定做了另一种过滤；

其次是数据库，blast2go可能取了不仅仅是NCBI里面的gene2go，还有其他的，还没搞明白；

最后是程序，是不是blast2go用了层次关联排除了一部分，挖出了一部分，我简直是醉了！！！

还有就是2016年了，做个小总结，虽然有几个月没更新（心烦的事情），但最终暂时解决了，明年会怎样？

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