关于线粒体全基因组下机的fastq文件如何过滤变成待分析的VCF文件。。。。具体过滤流程和相关参数,跪求大神帮忙指导!!!!必有重谢

人类线粒体全基因组二代测序原始数据过滤相关推荐

  1. 全基因组重测序基础及高级分析知识汇总

    全基因组重测序基础及高级分析知识汇总 oddxix 已关注 2018.09.20 17:04 字数 11355 阅读 212评论 0喜欢 6 转自:http://www.360doc.com/cont ...

  2. signature=d363d26bda212f777fef81d270ecd42b,基于DNA-pooling全基因组重测序初步筛查CAD易感基因变异位点...

    摘要: 目的:应用DNApooling全基因组重测序技术初步筛查CAD易感基因变异位点并进行功能分析.方法:分别收集CAD病例组血液样本和正常对照组血液样本各100例.提取病例组和对照组DNA,制作D ...

  3. 一个全基因组重测序分析实战

    Original 2017-06-08 曾健明 生信技能树 这里选取的是 GATK best practice 是目前认可度最高的全基因组重测序分析流程,尤其适用于 人类研究. PS:其实本文应该属于 ...

  4. 和dump文件_SRA数据库及下载二代测序原始数据转换为fastq文件

    一.SRA数据库: NCBI网站储存二代测序原始数据的数据库. (一)SRA数据类型: 1.Studies:研究课题 2.Experiments:实验设计 3.Samples:样品信息 4.Runs: ...

  5. 精准医学: 应用脑脊液游离DNA全基因组甲基化测序筛选小儿髓母细 胞瘤早期诊断与预后监测的可靠生物标志物|液体活检专题

    易点评 本文是液体活检DNA甲基化标志物发现的典型研究案例.儿童脑恶性肿瘤如髓母细胞瘤(MB)致癌基因突变频率较低,但DNA甲基化改变明显,根据MB的这一特点作者使用了WGBS和CMS-IP-seq技 ...

  6. 2020.8.5丨细菌基因组二代测序组装流程梳理

    目录 step:1 准备工作 step:2 数据过滤 比对参考基因组 安装BWA 建立索引 bwa一共有三种比对算法,这里使用mem 数据过滤 安装samtools 筛选三步走 step:3 组装 s ...

  7. 全基因组重测序基础分析

    本文仅为个人记录 流程说明 从零开始完整学习全基因组测序(WGS)数据分析:第3节 数据质控 2015a 2016a 全基因组测序数据获取后应该怎么分析 samtools samtools常用命令详解 ...

  8. 全基因组重测序揭示了野生大豆的局部适应和分化的特征

    近日,凌恩生物客户南京农业大学在<Evolutionary Applications>发表题为"Whole-genome resequencing reveals signatu ...

  9. 学习全基因组测序数据分析1:测序技术

    本文转载自微信公众号解螺旋的矿工,作者为黄树嘉,已获得授权.黄树嘉写了WGS系列的文章,堪称教科书级别的生物信息学习材料.虽然本平台只关注宏基因组领域,但此系列文章知识体系完善.干货满满,是值得每位专 ...

最新文章

  1. linux驱动:TI+DM8127+GPIO(五)之plarform
  2. 《数字逻辑设计与计算机组成》一3.3 加法器
  3. jenkins 反序列化漏洞 cve-2017-1000353
  4. Java网络编程实例---------------------------------基本HTTP客户端及服务端多线程
  5. eclipse插件安装的方法
  6. 电脑屏幕保护怎么取消_STEP考试安排再更新!今年到底要怎么考试?
  7. javascript学习(11)——[设计模式]工厂模式
  8. 按钮点击没有反应_时控开关按键没反应怎么办?
  9. python函数调用键盘热键_如何使用Python控制键盘和鼠标
  10. SQL Server 2014安装图解
  11. mumu模拟器点击无响应_常用安卓模拟器介绍?PC模拟器哪个好用
  12. python编程快速上手实例_Python编程快速上手——疯狂填词程序实现方法分析
  13. Day2--安装MediaWiki搭建自己的个人百科
  14. 2021-03-15
  15. 电平转换小结(避免翻车指南)
  16. 读书有益——》生僻字、可能念错的字
  17. 网络安全_密码学实验_非对称加密算法RSA
  18. 【我的世界原理分析】1.光照原理
  19. 奇安信Java后端一面
  20. 去除idea中xml黄色背景

热门文章

  1. google youtube 电影推荐算法
  2. 关于普通端口映射的原理
  3. 有哪些相见恨晚的APP学习软件?
  4. 新版标准日本语高级_第1课
  5. echarts3 地图只显示南沙群岛
  6. A. Vacations (dp 贪心
  7. Isler's WoWUI 全职业WoW原始风格包
  8. ES(Elasticsearch)集群节点角色
  9. 用笔记本电脑怎样录音?
  10. 最新数据处理 之 最新DSM(AW3D30)数据批量拼接--文末附数据获取方式