RNA-Seq分析软件HTSeq的安装
1.本人刚开始安装的时候,先下载相关的软件包,然后安装installtion中的方法安装,
运行的时候老是报错。根据错误提示安装解决方法。也参考了其他的笔友的一些建议,
发现特别麻烦,后来无意中发现有小伙伴用bioconda来安装,一个命令,简单快捷。
2.bioconda安装HTSeq操作如下:
下载安装miniconda(即bioconda)。
添加channels
等等
(具体步骤参考本人的相关bioconda的博客)
安装HTSeq的命令如下:
conda install HTSeq
输入上述命令,根据提示操作,可能有点慢。
安装完成后,测试一下HTSeq安装是否成功。
$ python(HTSeq在Python中运行)
>>> import HTSeq
上述操作Import HTSeq如果没有返回任何信息,
说明安装成功。
PS:bioconda真心好用啊,但是好像不是所有的安装都是
conda install softname,好像有的软件需要其他的参数
记着就好啦,反正暂时没有遇到。
转载于:https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/7499059.html
RNA-Seq分析软件HTSeq的安装相关推荐
- 一文掌握RNA seq,RNA seq课程大汇总
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具.RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面:从转录本在何时何地转录到RNA ...
- 关于流量分析软件brim最新安装方法
关于流量分析软件brim最新安装方法与简单使用 文章目录 关于流量分析软件brim最新安装方法与简单使用 网址 安装zui 安装brim 环境配置 简单使用 网址 在brim未进行改版之前,网站提供的 ...
- Gephi (网络分析软件) 下载、安装及简单使用
Gephi(网络分析软件)是一款完全免费的跨平台的网络分析工具,安装之后,需要安装Java JDK API,否则就会出现gephi打不开的情况,其主要用于各种网络和复杂系统,动态和分层图的交互可视化与 ...
- 微生物组分析软件 QIIME 2 安装小记
由于微信不允许外部链接,你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文",才能访问文中链接. QIIME 2 是一个功能强大,可扩展,分散式的(decentralized)微生物组分析软件 ...
- Data Analysis 软件(色谱质谱图分析软件)安装步骤
1.点击Agilent--GC-MS安装程序--GCMS E.02.01--Support--Agilent IO Libraries--双击setup.exe 安装(如果不能自动安装C++, vcr ...
- linux 软件安装
conda的安装 ## 下载,其实不需要,服务器已经下载好了,直接cp或者软链接即可 # wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/m ...
- 安装EPICS synApps中的软件包
准备: 在CentOS7上已经成功安装了EPICS base软件包:安装过程参见EPICS -- base的安装步骤详解_yuyuyuliang00的博客-CSDN博客 准备软件包: synApps_ ...
- RNA-Seq质控工具RseQC安装使用
RSeQC软件包提供了许多有用的模块,可以全面评估高通量序列数据,尤其是RNA序列数据.一些基本模块快速检查序列质量.核苷酸组成偏差.PCR偏差和GC偏差,而RNA序列特定模块评估测序饱和度.映射读取 ...
- sFlow-rt 3.0流量监控工具安装部署及简单实验
首先我敢说,现在网上没有谁的文章比我这篇实验记录更加全面.在做这个实验的过程中遇到了许多问题已经解决了,看了许多博客写的内容要不就是工具太落伍了,要不就是条理不清晰,要不就是省略了重要步骤,初学者看了 ...
最新文章
- Python二维离散余弦变换图像压缩应用(基于OpenCV)
- Hive学习笔记 —— Hive的管理
- Vs定义超大数组时,stack OverFlow的解决方法
- 程序不能使用中文名_这几款车没有中文名?那买车时应该怎么叫?
- java 百度poi_Android应用中使用百度地图API之POI(三)
- html中两个div垂直居中对齐,在div中垂直居中的两个元素
- 580显卡驱动_越贵的显卡越好吗?顶级AMD RX580功耗超过200W,RMB只买了外观?
- ue4 迁移模型_UE4换装系统(合并骨骼模型)
- 清空oracle的注册表,一键清除 Oracle注册表.bat
- 西电捷通IWN2410(V600)WAPI鉴别服务器生成的PEM(X.509)证书文件样式
- mantis最正确的安装步骤详解,不能实现你找我
- 孤独是人成熟的必经之路
- 【GAMES101】作业4(提高)含Bazier曲线的反走样处理
- 全国计算机等级考试怎么分级,【海贝推荐】全国计算机等级考试分级介绍
- Manjaro为包管理器pacman和yaourt\yay 添加多线程下载
- 地平线摄像头的音频调试至国际平台
- win7搜不到特定网络
- MongoDB系列六(聚合).
- 数据中心机房效果图鉴赏
- cpu计算机词汇中文意思是,CPU计算机口译词汇中英文对照1
热门文章
- 2015.11.27---Java
- cassandra 环境搭建
- android源码包下载
- UNIX环境编程学习笔记(21)——进程管理之获取进程终止状态的 wait 和 waitpid 函数...
- 程序员必知8大排序3大查找(一)
- mysql-5.7中的innodb_buffer_pool_prefetching(read-ahead)详解
- MyEclipse/Eclipse 中使用javap
- java 后台开发关键词解释
- linq中let关键字学习
- Android动画的实现 上