利用Mimics.19对肺支气管进行三维重构

MIMICS是Materialise's interactive medical image control system的缩写，是Materialise公司发明的一种医学影像控制系统，是模块化结构的软件，可以根据用户的不同需求有不同的搭配。

随着时代的发展，Mimics不仅可以用于医学领域，还可以运用于岩石测绘等结构体的三维重构即由二维图像向三维图像的转换过程。本文章是笔者在对肺部气管及支气管进行三维重构的研究中得出的一些思考。

本文将以Mimics19作为操作软件进行分析，若需要软件安装包或者有疑问请私信交流。

Show/Hide the volume rendering:

从二维图直接生成三维图像，右侧工具栏volume rendering一项内第二个点下拉可以消除软组织图像。

生成三维图像只可观察，不可生成STL文件/导出。

Original approach：

肉眼观察法选择阈值，手动擦除外层皮肤及其他组织。
气管被肺部包围，外层皮肤难以祛除，难以看清气管结构。

Final approach：

Segment->Pulmonary->Segment Airway：（主视图）在气管顶端空腔划线（从上向下方向），系统自动生成主干对应空间，退出全屏，选择Calculate 3D，自动生成主干部分3D模型。
Segment->Muscular->New mask：新建Mask，选择阈值：-161~1357，Segment->Muscular->Split mask，Region A 圈涂出支气管所在区域，Region B与Region A紧邻并1包裹Region A，每隔2-3帧圈涂一次（从气管恰出现对应的帧开始，至气管消失的帧结束），结束后选择Region A对应Mask，点击Calculate 3D，生成相应一侧的支气管。在转向另一侧操作时，需要再次New Mask，随后操作与之前相同。

3、File->Export->Binary STL ->3D->choose items->add->apply：生成并导出STL文件。（建议以日期_序号命名文件，并将文件存放于对应文件夹下）

（succeed）

后注：

对此文章讨论做法来说，会生成4个STL文件，笔者为了便于管理，将这四个STL文件放置在同一个文件夹中并打成压缩包形式进行保存。

笔者不才，最后得到的三维图形中有一些离散的数据集合，即游离于整体器官部分之外的值，若读者朋友对此有改善方法或者其他更好的做法欢迎留言评论或者私信笔者。

笔者做法与下面链接视频中的做法较为类似但又有所区别，读者朋友们可以按照自身需求各取所需。

笔者还参考了知网上的一些论文，如赵兴老师——基于CT影像的肺气管三维重构方法研究，感谢老师们的帮助与启迪。

若需要Mimics.19的操作说明也请私信，让我们共同进步！

Reference:

Video:

https://haokan.baidu.com/v?pd=wisenatural&vid=213763978867608480

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