R语言中的igraph包绘制网络图

本文转自网络。

R语言中的igraph包可以很方便地画出网络图，在社交关系分析等领域发挥重要作用，下面介绍包中一个重要的函数graph_from_data_frame（）。

graph_from_data_frame(d, directed = TRUE, vertices = NULL)

参数解释

（1）d: 格式为数据框，用来指定边序列；

（2）directed: 用于指定生成有向图（TRUE）还是无向图（FALSE）,默认TRUE;

（3）vertices: 格式为数据框，用于指定节点属性，默认NULL；

如果vertices没有指定（NULL），默认将数据框d的前两列作为边序列，其他列作为边的属性，节点的名称name按照边序列来确定；
如果vertices被指定为某数据框a，则将d的前两列作为边序列，其他列作为边的属性；将a的第一列作为节点名称（name），a的剩余列作为节点的其他属性，同时应注意一旦vertices被指定，那么d中指定的边序列必须都包含在a的第一列中，例如：

关于igraph输出的说明可参见：http://127.0.0.1:13971/library/igraph/html/print.igraph.html

实例

（1）选取gcookbook包中的数据集madmen，绘制无向图g

（2）可以发现，上图整体比较乱，标签之间出现大量重叠，因此进一步修改。

V()函数和vertex.XXX可以设置或获取节点vertices的属性；

E()函数和edge.XXX可以设置或获取边edge的属性。

上例中，第一行设置这个图形的属性；vertex.size=4设置节点大小；第三行中，虽然边和节点可能都有名字，但默认时这些名字可能没有被当做标签，因此需要给vertex.label参数传递一个命名向量；vertex.label.cex=0.7设置标签字体大小；vertex.label.dist=0.4,设置节点和标签的距离，便于错开重叠；vertex.label.color设置标签颜色。

上例中通过vertex.XXX的形式向plot函数传递参数后再输出，可以直接利用V()h函数，效果是等价的。

同样，也可以设置边的属性

上例中，E(g)表示查看边；E(g)[c(2,11,19)]$label设置第（2,11,19）边的标签，然后将所有边的颜色设置为灰色后，再把第（2,11,19）边设置为红色，宽度为2，最后以圆圈布局。

具体的参数设置可以查看帮助文档(？graph.plotting)：http://127.0.0.1:13971/library/igraph/html/igraph.plotting.html

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