python 文件名变量_如何将变量文件名传递给python ete？

我正在尝试使用以下代码从文件中加载newick字符串：

filename = templist[1].lower().replace(" ","") + ".nwk"

tt = Tree(filename, format=1)但得到以下错误：

tt = Tree(filename, format=1) # Loads a tree structure from a newick string. The returned variable tt is the root node for the tree.

File "/python2.7/dist-packages/ete2-2.2.1072-py2.7.egg/ete2/coretype/tree.py", line 225, in __init__

read_newick(newick, root_node = self, format=format)

File "/python2.7/dist-packages/ete2-2.2.1072-py2.7.egg/ete2/parser/newick.py", line 237, in read_newick

'Unexisting tree file or Malformed newick tree structure.'

ete2.parser.newick.NewickError: Unexisting tree file or Malformed newick tree structure.我已经验证了文件格式，并且确定。我想我以错误的方式传递变量，可以请您指导我将文件名作为变量传递。

当我通过文件名作为字符串而不使用变量它工作正常，但我需要使用变量值来加载树。

python 文件名变量_如何将变量文件名传递给python ete？相关推荐

python cmd命令循环传参数_将参数从cmd传递给python脚本
我在 python中编写脚本并通过输入以下命令运行cmd: C:\> python script.py 我的一些脚本包含基于标志调用的单独算法和方法. 现在我想通过cmd直接传递标志,而不是必须 ...
java线程条件变量_使用条件变量（多线程笔记）
条件变量属性: 使用条件变量可以以原子方式阻塞线程,知道某个特定条件为真为止.条件变量始终与互斥锁一起使用. 使用条件变量,线程可以以原子方式阻塞,知道满足某个条件为止.对掉件的测试时在互斥锁的保护下 ...
力控批量添加变量_力控变量.ppt
力控变量 3.1 变量类别 1.窗口中间变量 2.中间变量 3.数据库变量 4.间接变量 5.系统变量第1页/共18页 3.1.1 窗口中间变量窗口中间变量作用域仅限于力控应用程序的一个窗口,或者 ...
什么是变量_什么是变量？
什么是变量 A variable is a name for a place in the computer's memory where you store some data. 变量是计算机内存中 ...
python阿里巴巴排名_全自动监控网页关键词排名（Python实现）
在运行之前,先要把关键词按行分隔,保存成txt文件,并在运行参数中让脚本去读取它.每次运行之后,会在/home/rank/文件夹下,创建一个类似1970-01-01.csv这样文件名的文件,保存着当日 ...
python制作相册_《自拍教程73》Python 自动生成相册文件夹
这里将告诉您<自拍教程73>Python 自动生成相册文件夹,具体操作过程:案例故事: 接Python mediainfo批量重命名图片文件,测试图片是批量重命名好了, 但是将测试图片放于 ...
python 字符串拼接_面试官让用 3 种 python 方法实现字符串拼接？对不起我有8种……...
点击上方蓝字关注我们点击上方"印象python",选择"星标"公众号重磅干货,第一时间送达!之前发过很多关于 Python 学习的文章,收到大家不少的好评, ...
python ide 最好_我在iPad上最好的Python IDE
python ide 最好 Having finished my first year at university, and being left with very little to do thi ...
anaconda新建不同python版本环境_解决 Anaconda 与 ROS 冲突（python 版本与 opencv）
1. Python 版本冲突默认情况下,用 catkin_make 编译 ros 工作空间,依赖于 pyhton2.7,若在终端中输入 python,进入 python2.7 的环境,则没什么问题. ...
python入门教授_南开大学教授强力推荐的5本Python入门书籍，附电子版
筛选了2年内优秀的python书籍,个别经典的书籍扩展到5年内. python现在的主流版本是3.7(有明显性能提升,强烈推荐) 3.6, 不基于这两个或者更新版本的书,慎重选择.很多库已经不提供py ...

python 文件名变量_如何将变量文件名传递给python ete？

python 文件名变量_如何将变量文件名传递给python ete？相关推荐

最新文章

热门文章