windows 系统

前言

目前有两个版本的R可以下载，第一个版本在这里r-projet,缺点是默认单核运算，速度比较慢，优点是版本更新修复bug比较快，包安装起来比较友好。第二个版本是微软提供的microsoft-r-open,优点是默认多核运算，并且使用MKL(Intel®
Math Kernel
Library)加速矩阵运算，速度比较快，缺点是版本更新异常慢，包安装起来没有r-projet友好。今天，我将介绍结合这两个版本的优点，安装配置一个默认多核运算并且安装包比较有好的R。

安装前

保证用户名是英文的，如果是中文用户名，请重装系统并用英文用户名
在非系统盘位置，新建四个文件夹，比如
R_soft,R_studio,R_files,**R_tools **
安装路径不要包含中文，R对中文支持不好

下载相关文件

直接官网下载网速非常慢，下面给出国内镜像网站地址

R：(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/)
Rstudio:(https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download)
Rtools:(https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/)
MKL:
(https://software.intel.com/content/www/us/en/develop/tools/parallel-studio-xe/choose-download.html)

安装相关软件

一定要先安装 R 再安装 RStudio！

R：请选择英文路径，建议安装在一开始建立的R_soft文件夹里
Rstudio: 建议安装在一开始建立的R_studio文件夹里
Rtools:建议安装在一开始建立的R_tools文件夹里
MKL: 直接默认安装即可

配置Rtools

安装完以上软件后，启动安装好的Rstudio，输入以下命令并运行：

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

之后重启Rstudio,运行

Sys.which("make")

给出刚才你安装Rtools路径就表示你安装成功！！

下载常用到的包

启动Rstudio,输入以下命令，静静等待即可！

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
pkgs <- c("tidyverse","dplyr","tidyfst","fs","sf","mlr","mlr3","EDA","mice","plotly","randomForest","rpart","splines","mle4","ncdf4","gamma4","lubridate","stringr","tidyr","htmlwidgets","DT","gt","tidymodels","car","mgcv","survival","shiny","data.table","purrr","future","progress","tictoc","jsonlite","listviewer","skimr","devtools","rmarkdown","RcolorBrewer","knitr","Rcpp","plyr","rticles","pacman","beepr","laendR","drake","bayesplot","cowplot","hrbrthemes","janitor","nanirar","tidylog","validate","speedglm","fixest")
install.packages(pkgs,dependencies = T)

配置R

找到你刚才安装R的文件目录，进入以下目录**…/R_soft/R-4.0.2/etc** ,
用记事本打开
Rprofile.site文件，并参考以下代码选择性复制粘贴到这个文件。

#请修改自己的位置，用于存放你下载的安装包，建议放在非系统盘
.CUSTOM_LIB = "E:/R_files/R_library"
#请修改自己的位置，用于存放临时数据
.TMP = "E:/R_files/R_temp"
if(!dir.exists(.CUSTOM_LIB)){dir.create(.CUSTOM_LIB)
}
.libPaths(c(.CUSTOM_LIB, .libPaths()))
message("Using library: ", .libPaths()[1])
if(dirname(tempdir()) != .TMP){if(!dir.exists(.TMP)) dir.create(.TMP)cat(paste0("TMPDIR = ", .TMP), file="~/.Renviron", sep = "\n")
}
message("Using temp directory: ", .TMP)
##为xaringan 制作presentation服务
options(servr.daemon = TRUE)
##选择默认的镜像网址，加快安装包下载速度
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
# 设定字体，特别注意里面有一个 enfont 和 cnfont 是我最常用的两个字体。
windowsFonts(en_font = windowsFont("Times New Roman"),cn_font = windowsFont("思源宋体")
)
en_font = "en_font"
cn_font = "cn_font"# 设定 ggplot2 绘图主题
ggplot2::theme_set(hrbrthemes::theme_ipsum(base_family = 'en_font'))# 取消科学计数法的显示
options(scipen = 1)# 设定 ggplot2 的默认调色板
options(ggplot2.continuous.colour = "viridis",ggplot2.continuous.fill = "viridis"
)

配置Rstudio

能设定元素很多，建议仔细看看！下面只是部分例子：

Tools -> Global Options -> General

Tools -> Global Options -> Code

Tools -> Global Options -> Apperance

快捷键 是提高生产力的重要要素，建议设定一组自己能习惯的快捷键

配置MKL，开启多线程运算

安装好MKL以后，找打以下文件夹：

"C:\Program Files (x86)\IntelSWTools\compilers_and_libraries\windows\redist\intel64\mkl""C:\Program Files (x86)\IntelSWTools\compilers_and_libraries\windows\redist\intel64\compiler"

以上两个文件夹里所有的文件全部复制粘贴到
以下文件夹：“…2”,也就是你安装R的文件夹！
复制好以后在该目录下找到mkl_rt.dll文件，复制到桌面，不改变文件内容，修改文件名成Rblas.dll，并放回“…2”，直接覆盖原来的文件
同理找到mkl_rt.dll文件，复制到桌面，不改变文件内容，修改文件名成Rlapack.dll
，并放回“…2”，直接覆盖原来的文件

恭喜你，大功告成，感受一下MKL加速后运算速度有多快，尝试运行以下以下代码，同时你可以拿其他单核运算电脑运行下同样的代码，对比下运行速度。

m <- 10000
n <- 2000
a <- matrix(runif(m*n),m,n)
system.time(s <- svd(a,nu=0,nv=0))##    user  system elapsed
##   14.42    0.58    2.06

提醒:这步配置好可以卸载MKL，以释放空间！！！

致谢

经过一段时间的学习，算是有那么一丁点入门R了，感谢在成长路上指导帮助我的每一位，首先是自己的导师王斌老师，能给与支持和鼓励，感谢薛涛老师不厌其烦的解答我的每一个细节，感谢Rstata学院的老师同学们耐心又及时解答疑惑，感谢黄天远大神及其在大神组的群里每一个大牛们的技术指导，感谢华东吴亦凡（公众号：pypi主人）用爱发电，感谢王诗翔（公众号：优雅R）分享技术，感谢送哥、霸哥、stone哥等等所有技术大哥给予的指导和帮助!!!

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