©作者|善财童子

学校|西北工业大学

研究方向|机器学习/射频微波

在知乎看到一篇讲解线性判别分析(LDA,Linear Discriminant Analysis)的文章,感觉数学概念讲得不是很清楚,而且没有代码实现。所以童子在参考相关文章的基础上在这里做一个学习总结,与大家共勉,欢迎各位批评指正~~

注意:在不加说明的情况下,所有公式的向量均是列向量,这个也会反映到代码中。

本文的基本思路来自以下文章:

https://www.adeveloperdiary.com/data-science/machine-learning/linear-discriminant-analysis-from-theory-to-code/

基本概念和目标

线性判别分析是一种很重要的分类算法,同时也是一种降维方法(这个我还没想懂)。和 PCA 一样,LDA 也是通过投影的方式达到去除数据之间冗余的一种算法。

如下图所示的 2 类数据,为了正确的分类,我们希望这 2 类数据投影之后,同类的数据尽可能的集中(距离近,有重叠),不同类的数据尽可能的分开(距离远,无重叠),左图的投影不好,因为 2 类数据投影后有重叠,而右图投影之后可以很好地进行分类,因为投影之后的 2 类数据之间几乎没有重叠,只是类内重叠得很厉害,而这正是我们想要的结果。

正交投影

因为 LDA 用到了投影,所以这里有必要科普一下投影的知识。以二维平面为例,如图所示

我们要计算向量 在 上的投影 ,很显然 与 成比例关系:,其中 是一个常数。我们使用向量正交的概念来求出这个常数 。在上图中,向量 , 与 垂直,它们的内积为 0,即 ,即

注意:对于两个向量 x 和 y, ,所以有 。

假设 w 是一个单位向量,则 ,这样,对于任意向量 x,其在 w 上的投影 可表示为:

其中,  是一个常数。

对于一个数据集 ,其中 ,i=1,2,3,...m 是 d 维列向量。同样假设 w 是一个单位向量,那么每一个 在 w 的投影是:

上述公式的 是叫做 在 w 上的偏移或者坐标。这一系列的值 表示我们做了一个映射 ,即通过投影,我们将 d 维向量降维到了 1 维。

投影数据的均值

为简化起见,我们先假设有 2 类数据,定义样本 :,其中 。

我们再定义 :

其中 是类别, 是所有类别为 的样本的集合。所有数据 投影到 w 后,求其均值:

其中, 是 数据集的均值,同理 的均值是 ,投影后的均值 。为了使投影之后数据可正确地分类,我们希望这 2 类数据的中心离得越远越好,也就是要使 最大,但是单独这个条件并不能保证能够正确地对每一个数据进行分类,我们还需要考虑每一类数据的方差,大的方差表示 2 类数据之间有重叠,小的方差表示 2 类数据之间没有重叠。

LDA 并没有直接使用方差的计算公式,而是采用如下的定义:

这个有个名称叫 scatter matrix,本文暂时将其翻译成散步矩阵吧。

总结一下,LDA 主要就两点:

(1)最大化各类数据中心的距离,也就是各类数据的均值之间的距离要最大;

(2)各类数据的散步矩阵之和要小,也就是每个类别中的数据尽可能地集中。

将上述两点整合在一起,得到一个优化公式:

这个公式也叫做 Fisher LDA,这样,LDA 的问题就是关于  最优化上述的公式。我们重写上述公式如下:

同理有  :

这样:

这样,LDA 目标优化函数就可以重写为:

对公式(9)关于  求导,并令其导数为 0,可得:

整理得:

公式(11)中 做了替代:, 是一个常量。如果 S 是非奇异矩阵,那么公式(11)左乘 得到:

最终,LDA 问题其实就是求 对应最大特征值,而我们前面要求的投影方向就是最大特征值对应的特征向量,我们将 LDA 问题化成了矩阵的特征值和特征向量的问题了。

上述推导针对二分类问题进行的,对于多分类问题, 矩阵的计算方式不变,而 矩阵需要采用如下的公式计算:

其中:

C 表示类别的个数; 表示第 i 类中样本的个数; 表示第 i 类样本的均值; 表示整个样本的均值。

关于矩阵微分可参考如下文章:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/24709748

https://zhuanlan.zhihu.com/p/24863977

这里提醒一下,对 关于 x 求导的结果是 ,如果 A 是对称矩阵,即 ,则 。公式(10)中因为 B 和 S 都是对称矩阵(由它们的定义可以看出是对称矩阵),所以对 关于 w 求导的结果是  2Bw ,即 ,同理 。

代码实现

import numpy as np
from sklearn import datasetsfrom sklearn.datasets import make_blobs
import matplotlib.pyplot as pltclass MyLDA:def __init__(self):passdef fit(self, X, y):# 获取所有的类别labels = np.unique(y)#print(labels)means = []for label in labels:# 计算每一个类别的样本均值means.append(np.mean(X[y == label], axis=0))# 如果是二分类的话if len(labels) == 2:mu = (means[0] - means[1])mu = mu[:,None] # 转成列向量B = mu @ mu.Telse:total_mu = np.mean(X, axis=0)B = np.zeros((X.shape[1], X.shape[1]))for i, m in enumerate(means):n = X[y==i].shape[0]mu_i = m - total_mumu_i = mu_i[:,None] # 转成列向量B += n * np.dot(mu_i, mu_i.T)# 计算S矩阵S_t = []for label, m in enumerate(means):S_i = np.zeros((X.shape[1], X.shape[1]))for row in X[y == label]:t = (row - m)t = t[:,None] # 转成列向量S_i += t @ t.TS_t.append(S_i)S = np.zeros((X.shape[1], X.shape[1]))for s in S_t:S += s# S^-1B进行特征分解S_inv = np.linalg.inv(S)S_inv_B = S_inv @ Beig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(S_inv_B)#从大到小排序ind = eig_vals.argsort()[::-1]eig_vals = eig_vals[ind]eig_vecs = eig_vecs[:, ind]return eig_vecs#构造数据集
def make_data(centers=3, cluster_std=[1.0, 3.0, 2.5], n_samples=150, n_features=2):    X, y = make_blobs(n_samples, n_features, centers, cluster_std)return X, yif __name__ == "__main__":X, y = make_data(2, [1.0, 3.0])print(X.shape)lda = MyLDA()eig_vecs = lda.fit(X, y)W = eig_vecs[:, :1]colors = ['red', 'green', 'blue']fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))for point, pred in zip(X, y):# 画出原始数据的散点图ax.scatter(point[0], point[1], color=colors[pred], alpha=0.5)# 每个数据点在W上的投影proj = (np.dot(point, W) * W) / np.dot(W.T, W)#画出所有数据的投影ax.scatter(proj[0], proj[1], color=colors[pred], alpha=0.5)plt.show()

4.1 2类2个特征

if __name__ == "__main__":X, y = make_data(2, [1.0, 3.0]) #rint(X.shape)lda = MyLDA()eig_vecs = lda.fit(X, y)W = eig_vecs[:, :1]colors = ['red', 'green', 'blue']fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))for point, pred in zip(X, y):# 画出原始数据的散点图ax.scatter(point[0], point[1], color=colors[pred], alpha=0.5)# 每个数据点在W上的投影proj = (np.dot(point, W) * W) / np.dot(W.T, W)#画出所有数据的投影ax.scatter(proj[0], proj[1], color=colors[pred], alpha=0.5)plt.show()

运行结果是:

可见,数据投影后在 1 维上可以很好的分类。

4.2 3类2个特征

if __name__ == "__main__":# 3类X, y = make_data([[2.0, 1.0], [15.0, 5.0], [31.0, 12.0]], [1.0, 3.0, 2.5])print(X.shape)lda = MyLDA()eig_vecs = lda.fit(X, y)W = eig_vecs[:, :1]colors = ['red', 'green', 'blue']fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))for point, pred in zip(X, y):# 画出原始数据的散点图ax.scatter(point[0], point[1], color=colors[pred], alpha=0.5)# 每个数据点在W上的投影proj = (np.dot(point, W) * W) / np.dot(W.T, W)#画出所有数据的投影ax.scatter(proj[0], proj[1], color=colors[pred], alpha=0.5)plt.show()

运行结果是:

4.3 3类4个特征

if __name__ == "__main__":#X, y = load_data(cols, load_all=True, head=True)X, y = make_data([[2.0, 1.0], [15.0, 5.0], [31.0, 12.0]], [1.0, 3.0, 2.5], n_features=4)print(X.shape)lda = MyLDA()eig_vecs = lda.fit(X, y)# 取前2个最大特征值对应的特征向量W = eig_vecs[:, :2]# 将数据投影到这两个特征向量上,从而达到降维的目的transformed = X @ Wplt.subplots(figsize=(10, 8))plt.scatter(transformed[:, 0], transformed[:, 1], c=y, cmap=plt.cm.Set1)plt.show()

运行结果如下:

对上述结果使用 sklearn 官方实现的 LDA 进行对比验证:

if __name__ == "__main__":X, y = make_data([[2.0, 1.0], [15.0, 5.0], [31.0, 12.0]], [1.0, 3.0, 2.5], n_features=4)print(X.shape)lda = MyLDA()eig_vecs = lda.fit(X, y)# 取前2个最大特征值对应的特征向量W = eig_vecs[:, :2]# 将数据投影到这两个特征向量上,从而达到降维的目的transformed = X @ Wplt.subplots(figsize=(10, 8))plt.scatter(transformed[:, 0], transformed[:, 1], c=y, cmap=plt.cm.Set1)plt.title('self-implementation')from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysissk_lda = LinearDiscriminantAnalysis()sk_lda.fit(X, y)transformed = sk_lda.transform(X)plt.subplots(figsize=(10, 8))plt.scatter(transformed[:, 0], transformed[:, 1], c=y, cmap=plt.cm.Set1)plt.title("sklearn's offical implementation")plt.show()

左图是本文实现的 LDA 分类结果,右图是官方实现的 LDA 分类结果,可见,两者的结果是一致的。

总结

LDA 是一个很强大的工具,但它是一个有监督的分类算法,PCA 是一个无监督的算法,这是和 PCA 的一个很重要的区别。

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