中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）

假设中性突变的频率分别为P和1-P，则其突变年龄为：-4Ne[p*( log_ep)+(1-p)* log_e (1-p)]

The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p：-4Ne[p*( log_ep)+(1-p)* log_e (1-p)];

这里，Ne为有效群体大小，假定一个群体的有效群体大小是5000，某个SNP突变频率分别为0.1和0.9,则其突变年龄为：

-4*5000*(0.1*log(0.1)+0.9*log(0.9))= 6501.659

这里的6501单位为generation，一个generation是25年。所以突变年龄是：6501.659*25

公式出处：

1、The age of a neutral mutant persisting in a finite population. Genetics 75:199–212

2、Dating the Origin of the CCR5-D32 AIDS-Resistance Allele by the Coalescence of Haplotypes

转载于:https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/9463109.html

中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）相关推荐

城市大脑已经几岁？城市大脑发展成熟度的年龄评估模型（修改版）
说明:该论文由科学院研究团队刘颖.刘锋于2022年7月发表在<科技导报>第14期,是对城市大脑发展成熟度的探索研究,为构建城市大脑发展成熟度评估规范提供参考.根据研究团队建立的评估模型,进 ...
本周最新文献速递20210801
本周最新文献速递20210801 一.精细解读文献一文献题目: Molecular architecture of the developing mouse brain 不想看英文题目: 发育中的 ...
突变检测软件测试数据库,合作文章|变异检测软件技能大PK，谁才是Battle King？...
DNA变异是个体间遗传变异的重要来源之一.第二代测序技术(NGS)和第三代测序技术(TGS)都在遗传变异研究中大放异彩.许多变异检测工具可以用来解析二代或三代数据,但是目前没有软件能兼顾灵敏性和特异性 ...
杭州市城市大脑发育年龄已达15.9岁
来源:城市大脑研究院导语该论文由科学院研究团队刘颖.刘锋于2022年7月发表在<科技导报>第14期,是对城市大脑发展成熟度的探索研究,为构建城市大脑发展成熟度评估规范提供参考.根据城市 ...
利用人脸图片准确识别年龄：上海大学研究者提出「深度回归森林」
根据面部图像评估人物年龄通常被认为是一个非线性回归问题,其主要挑战是关于年龄的面部特征空间是异构的.在上海大学.约翰霍普金斯大学.南开大学与海康威视等机构提交的新论文中,研究人员提出了深度回归森林(D ...
使用python+Keras检测年龄和性别
目标本文的主要目的是通过给定的数据集检测年龄和性别.我们将使用简单的 python 和 Keras 方法来检测年龄和性别. 数据集:https://www.kaggle.com/nipunarora ...
从眼中窥视：Google AI 模型如何通过眼睛预测你的年龄
新的模型可以通过分析眼部照片揭示衰老的秘密近年来,谷歌一直在研究各种人工智能模型,可以分析眼睛(内部和外部)的图像并监测某些参数.正如之前提到的,开发能够从眼睛中提取信息的 AI 模型意味着能够以经 ...
绝对不容错过：最完整的检测模型评估指标mAP计算指南(附代码)在这里！
点击上方"小白学视觉",选择加"星标"或"置顶" 重磅干货,第一时间送达前言本文翻译自Measuring Object Detectio ...
Java：出生日期转年龄
private int getAge(Date birthDay) {Calendar cal = Calendar.getInstance();//出生日期晚于当前时间,无法计算if (cal.be ...

中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）

中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）相关推荐

最新文章

热门文章