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FT-ICR MS进阶之路

内容：DataAnalysis操作，Origin作图

练习时间：20分钟

Billboard:

• 高分辨质谱数据处理是一项复杂的工作，本文进介绍基本的软件操作。

• 欢迎各位投稿，介绍自己的工作，分享经验，共同促进课题组进步。

DataAnalysis 软件

1. 打开文件

打开文件夹，选定数据文件(.baf后缀)

2. 设置数值显示精度

在MassSpectra 窗口右键单击，再左键单击Display parameters，在弹出窗口的

massprecision中输入5。

3. 谱图缩放

按下shift键，同时鼠标左键框选区域。

在MassSpectrum 窗口右键单击-Auto-Scaling恢复原始窗口。

4. 生成分子式

在菜单栏依次选择Tools-GenerateMolecular Formula，在弹出窗口Min和Max后

设定元素种类及原子个数，

5. 内校准数据

以天然水体有机物中常见的含氧化合物为标准，校正质荷比m/z。

原理请参考：Sleighter, R.L., et al., Limnology andOceanography-Methods,

2008. 6: p. 246-253.

注：选取至少4个质量点校准，受图片大小限制未完全显示全过程。

校准表为依据IUPAC相对原子质量计算出的离子精确质量，包含分子式(准分子离子)、理论精确质量、电荷数，为后缀为.ref的文件，可用windows记事本打开编辑。

6. 导出数据

更改数据列，显示m/z、I、S/N列全选所有数据，复制到剪贴板后，可将数据粘贴

为“.txt”或 “.xlsx”格式。

Molecular Formula Assignment

7. 分子式匹配

分子式匹配软件存在不同版本，本文暂不涉及。

8. 常用的饱和度表示参数

参考文献：

Melendez-Perez JJ, et al. A reformulatedaromaticity index equation under consideration for non-aromatic andnon-condensed aromatic cyclic carbonyl compounds. Organic Geochemistry. 2016;95:29-33. 

Seidel M, et al. Biogeochemistry ofdissolved organic matter in an anoxic intertidal creek bank. Geochimica Et Cosmochimica Acta. 2014;140:418-434.

Visualization

9. DBE_C气泡图

(1). 从EXCEL表格中筛选出某一类型(CLASS)化合物，将C、DBE、INTENSITY列复制到Origin作图软件中。

(2). 在Origin作图软件中选择C、DBE、INTENSITY列，点击气泡图，再自定义格式，图例等。

10. Van Kreveklen Diagram

(1). 负离子模式电离产生准分子离子峰 [M-H]+, 因此计算H/C时需将氢原子数+1，氧原子数无需修改。建议按杂原子类型筛选出同类杂原子化合物作图，如只含CHO原子的化合物。(受图片格式限制，下图仅演示H/C计算过程)

(2).在Origin作图软件中选择H/C、O/C、INTENSITY列，点击颜色映射图，再自定义格式，图例等。

11. 化合物类型、DBE堆叠柱状图

(1). 以CLASS、DBE分别为行、列字段

(2). 以INTENSITY为值(注意字段设置为求和，而不是计数), 创建数据透视表，并根据数据透视表作堆叠柱状图，拖动ClASS类型(注意动图中光标形状)排序，以便分析数据规律。

...END...