r library car_医学统计与R语言:协方差分析(ANCOVA)+plus
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输入1:
library(rio)covdata "covariancedata.sav")covdata$group group)library(dplyr)covdata %>% group_by(group)%>% sample_n(5)
结果1:
group PSQI1 PSQI2
输入2:
covdata %>% group_by(group)%>%summarize_at(vars(PSQI1,PSQI2),funs(n(),mean(.,na.rm=T),sd(.,na.rm=T)))
aggregate(cbind(PSQI1,PSQI2) ~ group, data = covdata,mean)
结果2:
group
输入3:
fit group,data=covdata)summary(fit)
结果3:
Df
输入4:
fit1 group,data=covdata)summary(fit1)
结果4:
Df
Anova(fit1 , type = "III")
输入5:
library(effects)
结果5:
group
输入6:
TukeyHSD(fit1,
结果6:
Tukey multiple comparisons of means
输入7:
library(multcomp)postHocsgroup ="Tukey"))summary(postHocs)
结果7:
for General Linear Hypotheses
输入8:
par(mfrow=c(2,2))plot(fit1)
结果8:
输入9:
$residuals)
结果9:
Shapiro-Wilk normality test
data: fit1$residualsW = 1, p-value = 0.5
输入10:
library(car)leveneTest(fit1$residuals ~ group, center = mean, data = covdata)
结果10:
's Test for Homogeneity of Variance (center = mean)
输入11:
"HH")
结果11:
输入12:
library(ggpubr)ggscatter(covdata, x="PSQI1", y="PSQI2",color="group",shape=19,size=2.5,mean.point=T,mean.point.size=5,add="reg.line")+ stat_regline_equation(aes(label = paste(..eq.label.., ..rr.label.., sep = "~~~~"), color = group))
ggplot(covdata,aes(x=PSQI1,y=PSQI2,color=group))+geom_point(aes(shape= group), size = 3) + geom_smooth(method = "lm", aes(fill = group), alpha = 0.1) +
labs(x = "PSQI1评分", y = "PSQI2评分")+theme(legend.position = "top")
结果12:
输入13:
library(rstatix)pwc <- emmeans_test(PSQI2~group, covariate = PSQI1,p.adjust.method = "bonferroni",data=covdata)pwc
结果13:
A
输入14:
get_emmeans(pwc)
结果14:
A
输入15:
res
结果15:
ANOVA
输入16:
"group",
结果16:
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