近期，许多小伙伴咨询小编如何进行径向分布函数分析，如湖南大学材料科学与工程学院刘海蓉老师课题组发表在物理学报的一文：《冷速对液态金属Mg凝固过程中微观结构演变的影响》中，通过对金属Mg在不同温度下的径向分布函数（RDF）分析，表征液态金属Mg凝固过程的结构演变，如下图文中的液态金属 Mg 在不同冷却速度下凝固的双体分布函数 g(r) 曲线：

图参考自：吴博强，刘海蓉，刘让苏. 冷速对液态金属Mg凝固过程中微观结构演变的影响. 物理学报，2017.

小编之前出过一期利用命令输出RDF数据的教程，见历史图文消息：lammps输出RDF

本文将介绍如何利用OVITO软件输出RDF曲线及数据。

1.具体步骤

1.导入dump文件

在OVITO软件中导入我们的结果dump文件。

2.Add modification--Coordination analysis

（可以提前选择需要输出RDF的原子）

3. 此时可以看见在右下角的窗口中已经显示了Radial distribution function 曲线

4.勾选Compute partial RDFs,输出双体分布函数或者只输出已选择的原子的RDF（小编这里只有一种原子）

5.但OVITO生成的RDF曲线图效果并不是很好，我们可以保存RDF数据，利用绘图软件重新绘制，点击图像窗口下方的Data Tables

6.点击数据按钮，就可以看见当前帧的RDF数据了

7.可以直接复制表里的数据也可以将表中数据保存为文本文件，就可以用数据重新画图了。

[lammps教程]OVITO输出RDF相关推荐

lammps输出RDF（径向分布函数）详解及示例教程
原创一直陪着你的 LAMMPS交流站 2021-10-18 11:40 收录于话题#lammps案例16个内容大家好,小编最近的课题需要输出RDF(径向分布函数),小编就去lammps官网及网络查 ...
lammps教程：径向分布函数g(r)的计算与输出方法
大家好,我是小马老师. 本文介绍如何使用lammps计算径向分布函数g®. 径向分布函数(Radial distribution function)是指给定某个粒子的坐标,其他粒子在空间的分布几率. ...
lammps教程：平均值输出fix ave/time命令详解
lammps模拟输出方式有很多,前面几篇文章也介绍过,对于模拟总体系的值一般使用thermo命令输出,而单个原子的变量值使用dump命令输出. 今天主要讨论一下体系量值的输出,使用thermo命令有两 ...
lammps教程：实例讲解npt、nvt系综的选择
对于lammps新手来说,系综的选择令人困惑,到底是应该用nvt系综还是npt系综? 我在初学lammps时就被这个问题困扰了很久.如果去问别人,可能会告诉你一个答案:根据模拟需要确定. 其实和没说一 ...
用正则表达式输出rdf文档的三元组格式数据
占个位置 1.输出所有尖括号里的内容 package com.jena;import java.io.BufferedReader; import java.io.FileReader; import ...
lammps教程：delete_atoms删除原子后原子ID不连续的两种解决方案
大家好,我是小马老师. 使用lammps自带命令建模时,有时候会用delete_atoms命令删除部分原子,但是在删除原子后,lammps并不一定会重新分配原子的ID,造成data文件中的原子ID序号 ...
lammps教程：均方位移MSD计算方法介绍
大家好,我是小马老师. 在lammps扩散模拟中,大多需要计算MSD,今天分享一段MSD的代码: compute 1 all msd com yes variable msdx equal c_1[1 ...
lammps教程：Cu孪晶建模方法
上一次文章介绍了Atomsk软件建立孪晶的方法,有朋友咨询使用lammps自带命令建立孪晶的方法. 本文以Cu为例介绍lammps孪晶建模方法. 使用lammps建模,首先要确定xyz坐标轴对应的晶向 ...
蓝桥杯物联网基础图文教程——GPIO输出控制LD5亮灭
蓝桥杯物联网基础教程--GPIO输出控制LD5亮灭 (本系列教程针对一些有stm32基础的同学,需要参加蓝桥杯物联网竞赛的,对HAL库感兴趣的同学提供参考,本文不再详细赘述关于stm32基础原理指导) ...
lammps教程：lj/cut/coul力场参数设置详解
本文介绍lj/cut/coul/cut以及lj/cut/coul/long力场的区别和用法. 前面一篇文章介绍了LJ势的用法,普通的LJ势只考虑原子之间的吸引力与排斥力,没有考虑原子之间电荷作用. 如 ...

[lammps教程]OVITO输出RDF

1.导入dump文件

2.Add modification--Coordination analysis

[lammps教程]OVITO输出RDF相关推荐

最新文章

热门文章