FASTA Format

FASTA格式又称Pearson的格式，该种序列格式要求序列的标题行以大于号">"开头，下一行起为具体的序列。一般建议每行的字符数不超过60个，以方便程序处理。多条核苷酸序列格式即将该格式连续列出即可.

- This format contains a single header line providing the sequence name, and optionally a description, followed by lines of sequence data.
- Sequences in FASTA formatted files are preceded by a line starting with a " >" symbol.
- The first word on this line is the name of the sequence. The rest of the line is a description of the sequence.

Term Entry Name Molecule Type Gene Name Sequence Length

e.g. FOSB_MOUSE Protein fosB 338 bp

The remaining lines contain the sequence itself, usually formated to 60 characters per line.
Depending on the application blank lines in a FASTA file are ignored or treated as terminating the sequence
Depending on the application spaces or other non-sequence symbols (dashes, underscores, periods) in a sequence are either ignored or treated as gaps.
FASTA files containing multiple sequences are just the same, with one sequence listed right after another. This format is accepted for many multiple sequence alignment programs.

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