导读:近几年,MSI在指南共识中的推荐地位不断上升,MSI检测结果在指导免疫治疗上有很强的特异性。因此,获取更准确的MSI状态与患者获益息息相关,有研究表明不同位点在中国人群中MSI检出率不同,指南推荐的位点(2B3D NCI Panel)检出率比没有指南推荐的位点(6个单核苷酸位点)检出率高一倍(13.5% VS 6.31%)。本文中,刘东戈教授将为大家溯源为何2B3D是CSCO指南推荐的具有重要意义的MSI检测位点:

微卫星不稳定性(Microsatellite instability,MSI)现已成为非常重要的泛癌种标志物,美国癌症研究中心不分肿瘤发生部位,将所有高度微卫星不稳定(MSI-H)的肿瘤定义为MSI-H肿瘤,相比MSS或MSI-L肿瘤,MSI-H肿瘤能够从免疫治疗中显著获益。因此,MSI现在最重要的临床意义就是指导泛癌种实体瘤免疫治疗。除此之外,MSI检测不仅是筛查林奇综合征的重要手段,其检测结果还能预测胃肠肿瘤预后,指导术后化疗方案制定。

基于MSI的重要临床检测意义,中国临床肿瘤学会发布的CSCO肿瘤诊疗指南中,多个癌种指南都强烈推荐MSI检测,包括CSCO结直肠癌诊疗指南(I级推荐)、CSCO胰腺癌诊疗指南(I级推荐)、CSCO胃癌诊疗指南(I级推荐)、CSCO食管癌诊疗指南(I级推荐)、CSCO卵巢癌诊疗指南(III级推荐)、CSCO胆道恶性肿瘤诊疗指南(III级推荐)、CSCO前列腺癌诊疗指南。

而针对MSI的检测,CSCO指南唯一推荐的检测Panel,即由2个单核苷酸位点和3个双核苷酸位点组成的2B3D NCI Panel(BAT-25、BAT-26、D2S123、D17S250、D5S346),并给出了判定标准:5个位点中2个及2个以上的位点不稳定为MSI-H;1个位点不稳定为MSI-L;所有位点均稳定为MSS。

       图 1 CSCO指南唯一推荐2B3D NCI Panel作为MSI检测Panel

人类基因组中已知的微卫星位点数目多达1900多万个[1],由于前人的不断筛选和验证,最终2B3D NCI Panel成为CSCO指南唯一推荐的MSI位点。最早微卫星不稳定这种现象是在遗传性非息肉性结直肠癌(HNPCC,即林奇综合征)中被发现,当时Aaltonen教授团队在HNPCC和散发性结直肠癌的肿瘤组织中都发现一些双核苷酸重复的微卫星位点长度发生了变化,当时定义为复制错误(Replication Errors,RER)也就是后来的MSI,并且研究团队发现在HNPCC中这种现象的占比高达86%[2]。同一时期,Thibodeau教授团队研究发现MSI多发于近端结肠且与患者生存期延长呈显著相关[3]。

          图 2 HNPCC与散发性结直肠癌中均发现RER现象(2)

正因为MSI与HNPCC有非常大的相关性,MSI在早期也被用于筛查HNPCC,美国癌症研究中心(NCI)成立的针对微卫星不稳定检测的国际工作小组在1997年底举办了国际研讨会来总结和统一标准。研讨会将RER、MSI、MMP(microsatellite mutation phenotype)等描述微卫星不稳定现象的术语统称为了MSI,并再次明确MSI的定义:即相比正常细胞,肿瘤细胞中的微卫星位点的重复单元数目改变导致的DNA长度变化。

除此之外,研讨会通过回顾总结大量既往针对MSI检测位点检测性能评估的研究,最终,统一了以PCR方法检测2B3D 这5个最具代表性位点的方式来完成MSI检测并明确了判读标准,最终形成了第一个针对MSI检测的国际共识指南——NCI 指南(Bethesda指南)[4],这也是2B3D NCI Panel的诞生。

        图 3 1997年2B3D NCI Panel的提出与诊断标准制定(4)

2B3D NCI Panel被提出后得到了广泛推广和认可。同时,随着研究者们不断累积研究数据,人们对MSI的了解也更加深入。法国人类多态性研究中心发现,基于高加索人群和非洲人群数据,单核苷酸位点的MSI检测灵敏度略高于双核苷酸位点,并且采用单纯由5个单核苷酸位点(BAT25、BAT26、NR21、NR22、NR24)组成的Pentaplex Panel同样能够胜任MSI检测[5]。但值得注意的是,位点的检测特异性在不同人群中是不一样的,这个研究中的数据就明确显示这5个单个苷酸位点在高加索人中的特异性更高,非洲人群中特异性更低,这预示着不同种族的最适检测Panel可能会不一样。

图 4 Pentaplex Panel单苷酸位点数据显示不同人群的检测特异性存在差(5)

而后,美国Promega公司将Pentaplex Panel中的NR22位点替换成MONO27,组成了适合欧美人群的5个单核苷酸位点MSI检测Panel——Promega Panel,并加以推广。因此,2B3D NCI Panel和Promega Panel逐渐成为MSI检测的主流,广泛被国内外众多研究者使用,是NCCN指南和其他共识中推荐的两个检测Panel。同时,众多免疫检查点抑制剂的大型临床试验也都采用这两个Panel对MSI进行检测。

而2B3D NCI Panel从众多检测Panel中脱颖而出成为CSCO指南推荐的检测位点是有原因的。首先2B3D NCI Panel从被提出以来至今,仍被众多国内外指南共识所推荐,可见其稳定性和可靠性;其次,前文研究结论已经证实,不同检测位点对不同人群的检测特异性是不一样的,所以,检测性能也会有差异。有大量基于中国人群不同位点的检测数据显示,2B3D NCI Panel在中国人群中的检测性能最高,其次是Promega Panel[1, 6-7]。

            表 1 国内既往MSI-H检出率与检测位点报道汇总

综上所述,国内权威CSCO临床诊疗指南推荐2B3D NCI Panel作为MSI的检测位点,不仅因为2B3D NCI Panel是稳定可靠的MSI检测试剂盒,并且与欧美人群相比可能不同的是,2B3D NCI Panel在中国人群中检出率更高,可达到13.5%。

参考文献:

1.Bai WQ, Ma JF, Liu YY, et al. Screening of MSI detection loci and their heterogeneity in East Asian colorectal cancer patients. Cancer Med 2019;8:2157-2166.

2.Aaltonen LA, Peltomäki P, Leach FS, Sistonen P, Pylkkänen L, Mecklin JP, Järvinen H, Powell SM, Jen J, Hamilton SR, et al. Clues to the pathogenesis of familial colorectal cancer. Science. 1993 May 7;260(5109):812-6.

3.Thibodeau SN, Bren G, Schaid D. Microsatellite instability in cancer of the proximal colon. Science. 1993 May 7;260(5109):816-9.

4.Boland CR, Thibodeau SN, Hamilton SR, Sidransky D, Eshleman JR, Burt RW, Meltzer SJ, Rodriguez-Bigas MA, Fodde R, Ranzani GN, Srivastava S. A National Cancer Institute Workshop on Microsatellite Instability for cancer detection and familial predisposition: development of international criteria for the determination of microsatellite instability in colorectal cancer. Cancer Res. 1998 Nov 15;58(22):5248-57.

5.Suraweera N, Duval A, Reperant M, Vaury C, Furlan D, Leroy K, Seruca R, Iacopetta B, Hamelin R. Evaluation of tumor microsatellite instability using five quasimonomorphic mononucleotide repeats and pentaplex PCR. Gastroenterology. 2002 Dec;123(6):1804-11.

6.Zheng JM, Huang BX, Nie X, et al. The clinicopathological features and prognosis of tumor MSI in East Asian colorectal cancer patients using NCI panel. Future Oncol 2018;14:1355-1364.

7.Zhang C, Ding H, Sun S, Luan Z, Liu G, Li Z. Incidence and detection of high microsatellite instability in colorectal cancer in a Chinese population: a meta-analysis. J Gastrointest Oncol. 2020 Dec;11(6):1155-1163.

8.LI X, LIU QH. Study on Microsatellite Instability in Colorectal Cancer Patients with Familial Predisposition. J China Med Univ 2006;37:410-408.

9.Jin P, Meng XM, Sheng JQ, et al. Clinicopathological Features of Non-familial Colorectal Cancer with High-frequency Microsatellite Instability. Chin Med Sci J 2010;25:228-232.

10.Yang BL, Gu YF. Microsatellite instability in sporadic colorectal cancer and its relationship with clinicopathological features. World Chinese Journal of Digestology 2007;15:1160-1164.

11.Jin P, Meng XM, Sheng JQ, et al. Clinicopathological Features of Non-familial Colorectal Cancer with High-frequency Microsatellite Instability. Chin Med Sci J 2010;25:228-232.

12.Meng WJ, Wang L, Yu YY, et al. Significance of microsatellite instability in sporadic stage II and III rectal cancer. Chongqing Med J 2010;39:2420-2426.

13.Peng JL, Tang T, Ye ZL, et al. The relationship of microsatellite instability state with loss of mismatch repair proteins and clinical pathological characteristics in sporadic colorectal cancers. Chin J Cancer Biother 2015;22:479-483.

14.Zhou LY, Wan MZ, Liu YP, et al. Assessment of Microsatallite Instability in Colorectal Carcinoma: A Comparison Between Immunohistochemistry and PCR Method. Cancer Res Prev Treat 2015;42:1231-1234.

15.Yan WY, Hu J, Xie L, et al. Prediction of biological behavior and prognosis of colorectal cancer patients by tumor MSI/MMR in the Chinese population. Onco Targets Ther 2016;9:7415-7424.

16.Jiang N. Relationship between microsatellite instability and clinicopathological features and prognosis in sporadic colorectal cancer. Acta Universitatis Medicinalis Anhui 2019;54:139-142.

17.Huang YQ, Yuan Y, Ge WT, et al. Comparative features of colorectal and gastric cancers with microsatellite instability in Chinese patients. J Zhejiang Univ-SC B 2010;11:647-653.

18.Li WQ, Li HN, Liu RQ, et al. Comprehensive Analysis of the Relationship Between RAS and RAF Mutations and MSI Status of Colorectal Cancer in Northeastern China. Cell Physiol Biochem 2018;50:1496-1509.

19.Wang Z, Tang XL, Wu XQ, et al. Mismatch Repair status between primary colorectal tumor and metastatic tumor, a retrospective consistent study. Biosci Rep 2019;39:BSR20190730.

20.Song YL, Wang LL, Ran WW, et al. Effect of Tumor Location on Clinicopathological and Molecular Markers in Colorectal Cancer in Eastern China Patients: An Analysis of 2,356 Cases. Front Genet 2020;11:96.

刘东戈教授|追本溯源—2B3D是CSCO推荐具有重要意义的MSI检测位点相关推荐

  1. 语言孪生素数问题_刘建亚教授讲述“素数的故事”

    2020年9月28日是孔子诞辰2571周年纪念日,为礼敬先师.弘扬数学文化.传承数学思想,中国数学会联合中国工业与应用数学学会.中国运筹学会邀请刘建亚教授为大家献上题为"素数的故事" ...

  2. 两万字,清华刘云浩教授回答新生关于AI的90个问题

    大数据文摘授权转载自清华招生 8月1日,一个好消息备受瞩目: 清华大学依托精密仪器系的 类脑计算研究中心施路平教授团队 开发出全球首款异构融合类脑计算芯片 --"天机芯"! 该芯片 ...

  3. 中国人工智能研究领域开拓者刘叙华教授逝世,享年84岁

    大数据产业创新服务媒体 --聚焦数据 · 改变商业 数据猿报道 2020年5月11日15时31分,中国著名的计算机科学家,中国人工智能研究领域的开拓者,吉林大学计算机科学系奠基人之一,吉林大学计算机科 ...

  4. 我爱我家 CIO 刘东颖:如何靠六大维度提升“数字化”能力?|鲸犀峰会

    我爱我家 CIO 刘东颖:如何靠六大维度提升"数字化"能力?|鲸犀峰会 数字化转型到底应该做什么?数字化转型要从哪六个维度去解决问题? 近日,我爱我家CIO刘东颖在雷锋网主办的「鲸 ...

  5. 上海大学计算机学院客座教授,刘云虹教授受聘上海大学外国语学院客座教授并做学术讲座...

    11月29日14:00,南京大学外国语学院副院长.博士生导师刘云虹教授被我院聘为客座教授并做主题为<中国文学外译与翻译历史观>的学术讲座.学院副院长苗福光教授主持,副院长邓志勇教授(主持工 ...

  6. 哈佛大学刘小乐教授讲授的计算生物学和生物信息学导论 (2020 视频+资料)

    生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.高颜值在线绘图和分析.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流 ...

  7. 刘小乐教授 - 生物信息学云论坛第三场报告会

    ▼生物信息学习的正确姿势(第三版) NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程).单细 ...

  8. 柔性太阳能电池pdf_电子科大刘明侦教授团队钙钛矿太阳能电池研究取得重要进展...

    近日,电子科技大学材料与能源学院刘明侦教授团队在太阳能电池研究方面取得重要进展,在国际著名期刊<Nano Energy>.<Solar RRL>上连续发表多篇关于进一步提升钙钛 ...

  9. 国防科技大学计算机学院教授陈书民,国防科技大学刘新旺教授做客信息学院

    (通讯员 屈佩琪 范洲)2020年10月23日上午,应湖南师范大学信息科学与工程学院邀请,国防科技大学刘新旺教授在中和楼信息学院342报告厅做了题为"缺失多视图聚类算法研究"学术交 ...

最新文章

  1. html5自定义属性作用,html5自定义属性:如何获取自定义属性值(附代码)
  2. [unreal4入门系列之九] UE4创建空白关卡并添加碰撞体
  3. DIY穷人版谷歌眼镜,自定义手势操控,树莓派再一次被开发新玩法
  4. 多案分库分表带来的问题-分布式事务
  5. 【Python】自定义排序函数 - 示例
  6. 输入一个正整数求所有素数因子_一个数如果恰好等于它的因子之和,这个数就称为完数。编写应用程序求1000以内所有的完数...
  7. linux 模拟运行 微信,Ubuntu 18.04 安装微信(Linux通用)
  8. 移植内核过程的几个问题
  9. jQuery瀑布流插件 Masonry
  10. Python基于OpenCV实现视频数据切割为图像数据
  11. [PHP] PHP源码中的条件编译定义
  12. 大学数学实验习题--统计推断 (附答案)判断alpha,n与mu,sigma的估计区间长度的关系
  13. 《暗黑3》是如何设计随机地下城的?
  14. 【入门必看-算法基础知识讲解】小白都也能看得懂
  15. win10安装UOS双系统过程
  16. 矩阵的特征值和特征向量
  17. rear和length表示的循环队列
  18. (第五章) UI--PS基础 调色与校色
  19. 2019年南京大学计算机研究生复试分数线,2019南京大学研究生分数线汇总(含2016-2019历年复试)...
  20. 一些可以参考的文档集合4

热门文章

  1. 有关游戏中的探索测试体会
  2. dnf游戏币比例计算机怎么算,DNF:游戏币比例降低到1比35,究竟是好还是坏?老司机说出了心声...
  3. 用js写卡牌游戏(一)
  4. [软件人生]人格美容与素质和教养
  5. Java创建线程的两个方法
  6. CCAI 2017 | 刘燕:艺术与人工智能的明天——人机信任合作
  7. firework导出html到dw,将 Fireworks 与 Dreamweaver 一起使用
  8. 绝地求生刺激战场怎么维护服务器,绝地求生刺激战场更新维护公告
  9. 二手平台淘的明星同款穿搭?上95分看看
  10. 【Python 笔记】Linux下安装pip方法的全总结