本文转载自"态昌基因",已获授权。

本周,小昌决定

地分享一次文献。

本期论器:肝脏

肝病种类列出来有很多,比如:甲肝、乙肝、丙肝等等。。

其中,肝癌最让人害怕

听起来危险性比较低,但可能常碰到的肝病是:“脂肪肝”。

但我们不能因为感觉危险性不高就将其放在一边。

女性,从出生开始,身体的脂肪含量就比男性高,因为女性的身体会把吸收进来的热量部分转为脂肪,储存起来,转化比例比男性要高。所以,在同样吃喝的情况下,女性会更容易积累脂肪。

因此,我们要多关注女性脂肪肝,也要关注缓解脂肪肝的措施有哪些。

来看看这篇文章是怎么说的:

划重点

1. 脂肪肝人的菌群宏基因组特征
2. 微生物组对脂肪肝的影响

3. 脂肪肝相关的菌群和菌群代谢物调节脂肪肝

4. 预测模型

1 脂肪肝人的菌群宏基因组特征

研究人员为了解有脂肪肝人的粪便微生物的情况,招募了意大利和西班牙的病毒性肝炎阴性,非糖尿病女性患者,并对招募者的粪便进行宏基因组测序。

(0:未变性;1:一期变性;2:二期变性;3:三期变性)

根据对30个样本中700万个随机抽样读数获得的平均值得出基因计数,得到了一个基因计算,为“微生物基因丰度”(MGR)。结果显示,在门水平中,变形菌门、放线菌门以及疣微菌门与肝脏脂肪肝显著相关,同时发现MGR 与肝脏脂肪变性呈显著负相关关系,物种多样性与脂肪肝没有相关性。

而将微生物基因比对KEGG模块中的结果表明脂肪肝与微生物的碳水化合物,脂质和氨基酸代谢有正相关关系。尤其是LPS和肽聚糖的生物合成与肝脏脂肪变性显著相关

2 微生物组对脂肪肝的影响

为了探究可能与肠道微生物组和肝脏脂肪变性有关的代谢表型,研究人员通过1H-NMR光谱进行了尿液血浆代谢分析。结果发现,血浆和尿液中的大多数肝脂肪变性相关代谢物与低MGR相关。且在与脂肪变性和低MGR显著相关的微生物 - 哺乳动物共代谢物中,血浆PAA有最强的正相关性。在非脂肪性患者中观察到的高MGR与许多肠源性微生物代谢物显着相关,例如尿苯乙酰谷氨酰胺血浆乙酸盐和TMAO。这些结果表明存在与肝脂肪变性和低MGR相关的代谢表型。

为了产生可能对微生物群相关的二代测序治疗策略有用的分子假设,研究人员对同样病人的肝转录组进行信号通路影响分析,通过聚合所有KEGG网络,评估由2,277个基因组成的定向网络的拓扑结构,发现这些基因与肝脏脂肪变性显著相关,低MGR定位于涉及肝脏疾病的KEGG途径中。

3 脂肪肝相关的菌群和菌群代谢物调节脂肪肝

接着,研究人员在抗生素处理的小鼠身上做了粪便移植实验。在短暂的抗生素处理和清除期以及每天连续四次FMT后,给受体小鼠喂食饲料2周。结果显示接受脂肪肝患者肠道微生物小鼠肝脏,其甘油三酯适度但快速积累。表明人类粪便微生物群在引发肝脏脂肪变性中的因果作用,其在长期内可导致高度显着的肝脏脂质贮库

通过使用正交偏最小二乘法(O-PLS)模型,研究人员成功预测受体小鼠的表型反应,尤其是脂肪变性,肝脏甘油三酯含量,Fabp4和血浆缬氨酸水平,显示人供体微生物组和受体小鼠现象之间预测的统计稳定性。

由于PAA是脂肪变性相关的最强的微生物代谢产物,且在宏基因组和代谢组学观察到PAA的趋势相同。研究人员对与其相关的分子进行细胞、基因及蛋白水平研究,结果表明PAA可以显著增加肝脏BCAA利用和肝脏脂质积累。

4 预测模型

最后,研究人员通过拟合O-PLS判别分析(O-PLS-DA)构建了一个整合宏基因组,转录组学和代谢组学信息的多变量模型,使用来自O-PLS-DA模型的七倍交叉验证的评分,对脂肪变性(即脂肪变性与无脂肪变性)进行二元预测,从而证实分子表型和宏基因组学的联合预测能力。分子表型特征与肠道微生物组对脂肪变性现象的影响具有一致性,因此,可通过调节微生物组的疗法缓解脂肪肝。

这就是说,可以通过调节微生物组,改善脂肪肝情况

参考文献:

Lesley Hoyles , José-Manuel Fernández-Rea al et.Molecularphenomics and metagenomics of hepatic steatosis in non-diabetic obese women.Nature medicine  https://doi.org/10.1038/s41591-018-0061-3.

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