R包SangerSeqR处理ab1数据

#加载sangerseqR包
library(sangerseqR)#读入数据
seq = readsangerseq('input.ab1')#读取碱基数据，0.33指的是将达到主峰0.33的次峰定义为杂合子峰
bc = makeBaseCalls(seq, ratio = 0.33)#读主峰
primarySeq(seq)#读次峰
secondarySeq(seq)#输出可视化图像，也可以选择输出到pdf
chromatogram(bc, showcalls = 'both')

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