数据结构实验——病毒检测（KMP实现）

//此代码的NextVal数组以0开头

//需要在工程下建立“病毒感染检测输入数据.txt”文件

#include<iostream>
#include<fstream>
#include<string.h>
using namespace std;

typedef struct{
char ch[600]; //若是非空串，则按串长分配存储区，否则ch为NULL
int len; //串长度
}HString;

int* GetNextVal(const char *s, int len)
{

int *next = new int[len];
int i = 1;
int j = 0;
next[1] = 0;
while(i<len)
{
if(j==0 || s[i]==s[j])
{
++i;
++j;
next[i] = j;
}
else
{
j = next[j];
}
}
return next;
}

int KMP(const char *s, int slen,const char *t,int tlen)
{

int i,j;
int *next = GetNextVal(t, tlen);

i = 1;
j = 1;
while(i<=slen && j<=tlen)
{
if(j==0 || s[i]==t[j])
{
++i;
++j;
}
else
{
j = next[j];
}
}

if(j>tlen)
return i-tlen;
return 0;
}

void Virus_detection()
{
int num,m,flag,i,j; char Vir[600];
HString Virus,Person,temp;
ifstream inFile("病毒感染检测输入数据.txt");
ofstream outFile("病毒感染检测输出结果.txt");
inFile>>num;//读取待检测的任务数
while(num--) //依次检测每对病毒DNA和人的DNA是否匹配
{
inFile>>Virus.ch+1;//读取病毒DNA序列
inFile>>Person.ch+1;//读取人的DNA序列
strcpy(Vir,Virus.ch);
Virus.len=strlen(Virus.ch)-1;
Person.len=strlen(Person.ch)-1;
flag=0;//用来标识是否匹配，初始为0，匹配后为非0
m=Virus.len;
for(i=m+1,j=1;j<=m;j++) Virus.ch[i++]=Virus.ch[j];
//因病毒为环状，故将病毒的长度扩大2倍
//即可线性取到所有长度为Virus.len的字符串
Virus.ch[2*m+1]='\0'; //添加结束符号
for(i=0;i<m;i++)
{
for(j=1;j<=m;j++) temp.ch[j]=Virus.ch[i+j];
//取长为Virus.len的环形字符串
//即Virus.ch[0]-- Virus.ch[Virus.len-1],
//Virus.ch[1]-- Virus.ch[0], Virus.ch[2]-- Virus.ch[1]...
temp.ch[m+1]='\0'; //添加结束符号
temp.len=strlen(temp.ch)-1;

flag=KMP(Person.ch,Person.len,temp.ch,temp.len); //模式匹配

if(flag) break; //匹配即可退出循环
}//for
if(flag)
outFile<<Vir+1<<" "<<Person.ch+1<<" "<<"YES"<<endl;
else
outFile<<Vir+1<<" "<<Person.ch+1<<" "<<"NO"<<endl;
}//while
}

int main()
{
Virus_detection();
return 0;
}

病毒感染检测输入数据.txt

baa bbaabbba

baa aaabbbba

aabb abceaabb

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