5.1 数值和字符处理函数

常用的数学函数

统计函数

例子:

> x <- c(1,2,3,4,5,6,7,8)
> mean(x)
[1] 4.5
> sd(x)
[1] 2.44949

默认情况下,函数scale()对矩阵或数据框的指定列进行均值为0、标准差为1的标准化:

newdata <- scale(mydata)

要对每一列进行任意均值和标准差的标准化,可以使用以下代码:

newdata <- scale(mydata)*SD + M

概率函数

概率函数通常用来生成特征已知的模拟数据,以及在用户编写的统计函数中计算概率值。

字符处理函数

其他实用函数

示例:

R函数可以应用到一系列的数据对象上,包括标量,向量,矩阵,数组和数据框。

> a <- 5
> sqrt(a)
[1] 2.236068
> b <- c(1.243,5.654,2.99)
> round(b)
[1] 1 6 3
> c <- matrix(runif(12),nrow=3)
> c[,1]       [,2]      [,3]       [,4]
[1,] 0.1994530 0.13714175 0.9197887 0.92626099
[2,] 0.1545716 0.05410748 0.7442934 0.20239342
[3,] 0.3898991 0.71826297 0.4518926 0.02659162

> log(c)
            [,1]       [,2]      [,3]       [,4]
  [1,] -1.6121766 -1.9867402 -0.08361129 -0.07659924
  [2,] -1.8670979 -2.9167828 -0.29531995 -1.59754183
  [3,] -0.9418672 -0.3309195 -0.79431077 -3.62715915

> mean(c)
  [1] 0.4103881

上面的mean函数是求整个矩阵的平均数,如果要分别求整行或者整列的平均数时,R提供了一个apply()函数,使用格式为:

apply(x, MARGIN, FUN,...)

MARGIN=1表示行,MARGIN=2表示列。

> mydata <- matrix(rnorm(30),nrow=6)
> mydata[,1]       [,2]        [,3]        [,4]       [,5]
[1,]  0.04888185 -1.6841123  0.20826767 -0.18079844  0.8770435
[2,]  2.24945461 -0.1110540 -0.88960378 -0.28632932 -1.9787470
[3,] -0.14309448  0.4394450 -0.04371930 -0.71101344  0.2028341
[4,] -0.90665601 -0.7176465  0.38136328 -0.06082567 -0.3844853
[5,] -0.40884645 -0.3192920  0.08476159 -0.47544146  0.1809374
[6,]  1.40852339  0.3653756  0.09148512 -1.06787472  1.0503215
> apply(mydata,1,mean)
[1] -0.14614355 -0.20325589 -0.05110963 -0.33765005 -0.18757618  0.36956618
> apply(mydata,2,mean)
[1]  0.374710485 -0.337880697 -0.027907572 -0.463713840 -0.008682649
> apply(mydata,2,mean,trim=0.2)
[1]  0.22636608 -0.19565422  0.08519877 -0.41339566  0.21908240

apply()是一个很强大的函数,可以把函数应用到数组的某个维度上,而lapply()和sapply()则可将函数应用到列表上。

示例:将学生的各科考试成绩组合为单一成绩衡量指标、基于相对名次(前20%,下20%,等等)给出从A到F的评分、根据学生姓氏和名字的首字母对花名册进行排序。

1. 限定输出小数点后数字的位数。

> rosterStudent Math Science English
1         John Davis  502      95      25
2    Angela Williams  600      99      22
3   Bullwinkle Moose  412      80      18
4        David Jones  358      82      15
5  Janice Markhammer  495      75      20
6     Cheryl Cushing  512      85      28
7     Reuven Ytzrhak  410      80      15
8          Greg Knox  625      95      30
9       Joel England  573      89      27
10      Mary Rayburn  522      86      18

2. 由于数学、科学和英语考试的分值不同,在组合之前要先让他们变得可以比较。可以使用scale()函数来成绩进行标准化表示。

> z <- scale(roster[,2:4])
> zMath     Science     English
1   0.01269128  1.07806562  0.58685145
2   1.14336936  1.59143020  0.03667822
3  -1.02568654 -0.84705156 -0.69688609
4  -1.64871324 -0.59036927 -1.24705932
5  -0.06807144 -1.48875728 -0.33010394
6   0.12806660 -0.20534583  1.13702468
7  -1.04876160 -0.84705156 -1.24705932
8   1.43180765  1.07806562  1.50380683
9   0.83185601  0.30801875  0.95363360
10  0.24344191 -0.07700469 -0.69688609
attr(,"scaled:center")Math Science English 500.9    86.6    21.8
attr(,"scaled:scale")Math   Science   English
86.673654  7.791734  5.452828 

3. 然后,可以通过mean()函数来计算各行的均值以获得综合评分,并使用cbind()将其添加到花名册中

> score <- apply(z,1,mean)
> roster <- cbind(roster, score)
> rosterStudent Math Science English      score
1         John Davis  502      95      25  0.5592028
2    Angela Williams  600      99      22  0.9238259
3   Bullwinkle Moose  412      80      18 -0.8565414
4        David Jones  358      82      15 -1.1620473
5  Janice Markhammer  495      75      20 -0.6289776
6     Cheryl Cushing  512      85      28  0.3532485
7     Reuven Ytzrhak  410      80      15 -1.0476242
8          Greg Knox  625      95      30  1.3378934
9       Joel England  573      89      27  0.6978361
10      Mary Rayburn  522      86      18 -0.1768163

4. quantile()给出了学生综合得分的百分位数

> y <- quantile(roster$score, c(.8,.6,.4,.2) )
> y80%        60%        40%        20% 0.7430341  0.4356302 -0.3576808 -0.8947579 

5. 通过使用逻辑运算符,你可以将学生的百分位数排名重编码为一个新的类别型成绩变量。

> roster$grade[score >= y[1]] <- "A"
> roster$grade[score < y[1] & score > y[2]] <- "B"
> roster$grade[score < y[2] & score > y[3]] <- "C"
> roster$grade[score < y[3] & score > y[4]] <- "D"
> roster$grade[score < y[4]] <- "F"
> rosterStudent Math Science English      score grade
1         John Davis  502      95      25  0.5592028     B
2    Angela Williams  600      99      22  0.9238259     A
3   Bullwinkle Moose  412      80      18 -0.8565414     D
4        David Jones  358      82      15 -1.1620473     F
5  Janice Markhammer  495      75      20 -0.6289776     D
6     Cheryl Cushing  512      85      28  0.3532485     C
7     Reuven Ytzrhak  410      80      15 -1.0476242     F
8          Greg Knox  625      95      30  1.3378934     A
9       Joel England  573      89      27  0.6978361     B
10      Mary Rayburn  522      86      18 -0.1768163     C

6. 你将使用函数strsplit()以空格为界把学生姓名拆分为姓氏和名字。

5.3 控制流

for结构:循环重复地执行一个语句,直到某个变量的值不再包含在序列seq中为止。

for (var in seq) statement

while结构:循环重复地执行一个语句,直到条件不为真为止。

while (cond) statement

if-else结构:控制结构if-else在某个给定条件为真时执行语句,也可以同时在条件为假时执行另外的语句。

if (cond) statement1 else statement2

ifelse结构:这个结构是上一个结构的比较紧凑的向量化版本。

ifelse(cond, statement1, statement2)

switch结构:根据一个表达式的值选择语句执行。

switch(expr,...)

5.4 用户自编函数

function()

myfunction <- function(arg1, arg2, ...){statementsreturn(object)
}

函数中的对象只在函数内部使用。返回对象的数据类型是任意的,从标量到

5.5 整合与重构

1.转置

转置(反转行和列)是重塑数据集的众多方法中最简单的一个,用函数t()即可对一个矩阵或数据框进行转置。

> cars <- mtcars[1:5,1:4]
> carsmpg cyl disp  hp
Mazda RX4         21.0   6  160 110
Mazda RX4 Wag     21.0   6  160 110
Datsun 710        22.8   4  108  93
Hornet 4 Drive    21.4   6  258 110
Hornet Sportabout 18.7   8  360 175
> t(cars)Mazda RX4 Mazda RX4 Wag Datsun 710 Hornet 4 Drive Hornet Sportabout
mpg         21            21       22.8           21.4              18.7
cyl          6             6        4.0            6.0               8.0
disp       160           160      108.0          258.0             360.0
hp         110           110       93.0          110.0             175.0

2.整合数据

在R中使用一个或多个by变量和一个预先定义好的函数来折叠数据是比较容易的。

aggregate(x, by, FUN)

其中x是待折叠对象,by是一个变量名组成的列表,这些变量将被去掉以形成新的观测,而FUN则是用来计算描述性统计量的标量函数,他将被用来计算新的观测值。

> options(digits=3)
> attach(mtcars)
> aggdata <- aggregate(mtcars,by=list(cyl,gear),FUN=mean,na.rm=TRUE)
> aggdataGroup.1 Group.2  mpg cyl disp  hp drat   wt qsec  vs   am gear carb
1       4       3 21.5   4  120  97 3.70 2.46 20.0 1.0 0.00    3 1.00
2       6       3 19.8   6  242 108 2.92 3.34 19.8 1.0 0.00    3 1.00
3       8       3 15.1   8  358 194 3.12 4.10 17.1 0.0 0.00    3 3.08
4       4       4 26.9   4  103  76 4.11 2.38 19.6 1.0 0.75    4 1.50
5       6       4 19.8   6  164 116 3.91 3.09 17.7 0.5 0.50    4 4.00
6       4       5 28.2   4  108 102 4.10 1.83 16.8 0.5 1.00    5 2.00
7       6       5 19.7   6  145 175 3.62 2.77 15.5 0.0 1.00    5 6.00
8       8       5 15.4   8  326 300 3.88 3.37 14.6 0.0 1.00    5 6.00

3. reshape包

融合

数据集的融合是将它重构为这样一种样式:每个测量变量独占一行,行中带有要唯一确定这个测量所需的标识符变量。

此处用R内置的数据集,首先将列明改写成小写,然后查看相应的数据

> names(airquality) <- tolower(names(airquality))
> head(airquality)ozone solar.r wind temp month day
1    41     190  7.4   67     5   1
2    36     118  8.0   72     5   2
3    12     149 12.6   74     5   3
4    18     313 11.5   62     5   4
5    NA      NA 14.3   56     5   5
6    28      NA 14.9   66     5   6

先看用melt处理上述数据:

> aql <- melt(airquality)
No id variables; using all as measure variables
> head(aql)variable value
1    ozone    41
2    ozone    36
3    ozone    12
4    ozone    18
5    ozone    NA
6    ozone    28
> tail(aql)variable value
913      day    25
914      day    26
915      day    27
916      day    28
917      day    29
918      day    30

默认情况下,melt认为所有数值列的变量均有值。很多情况下,这都是我们想要的情况。在这里,我们想知道每个月(month)以及每天(day)的ozone, solar.r, wind以及temp的值。因此,我们需要告诉meltmonthday是"ID variables"。ID variables就是那些能够区分不同行数据的变量,个人感觉类似于数据库中的主键。

> aql <- melt(airquality, id.vars = c("month", "day"))
> head(aql)month day variable value
1     5   1    ozone    41
2     5   2    ozone    36
3     5   3    ozone    12
4     5   4    ozone    18
5     5   5    ozone    NA
6     5   6    ozone    28

如果我们想修改长数据中的列名:

> aql <- melt(airquality, id.vars = c("month", "day"),variable.name = "climate_variable", value.name = "climate_value")
> head(aql)month day climate_variable climate_value
1     5   1            ozone            41
2     5   2            ozone            36
3     5   3            ozone            12
4     5   4            ozone            18
5     5   5            ozone            NA
6     5   6            ozone            28

cast函数

在reshape2中有好几个cast版本的函数。若你经常使用data.frame,就需要使用dcast函数。acast函数返回向量、矩阵或者数组。

dcast借助于公式来描述数据的形状,左边参数表示"ID variables",而右边的参数表示measured variables。可能需要几次尝试,才能找到合适的公式。

这里,我们需要告知dcastmonthday是ID variables,variable则表示measured variables。

转载于:https://www.cnblogs.com/cyoutetsu/p/5944943.html

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