利用python计算fasta文件中ATGC的含量
1 #!/usr/bin/python3 2 #-*- coding:utf-8 -*- 3 "计算fatsa文件中的不同类型的碱基含量" 4 f=open('./test.txt','r') 5 line=f.read() 6 dict={} #创建一个空字典 7 for i in ['A', 'T', 'G', 'C']: 8 dict[i]=line.count(i) #字典赋值 9 print(dict) 10 f.close() 11
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