OR值的意义和计算公式，和95% CI

OR值的全称是oddratio,又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR值即是相对危险度的精确估计值。

计算公式如下：

Odd ratio, 95%CI

假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）:记为

Allele 1

Allele 2

	Allele1	Allele2
病例	A	B
对照	C	D

odds 值在病例和对照可以计算如下：

病例Allele1Odds =^{A (A + B)}/ _{B (A +B)}=^A/_B

对照Allele1Odds =^{C (C + D)} / _{D (C+ D)}=^C/_D

那么在这一点Allele1的OR值可以计算如下：

Odds Ratio =^{(A / B)}/_{(C /D)} =^AD/_BC

同样的，95% Confidence Intervals (CIs)值可以计算如下：

95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(¹/_A+¹/_B+¹/_C+¹/_D)^0.5

95% CI of OR = e^{95% CI ofln(OR)、}

logistic回归中，OR值=1，表示该因素对疾病的发生不起作用
OR值大于1，表示该因素是一个危险因素
OR值小于1，表示该因素是一个保护因素

^{同时最好要算出它的95%CI}

^{OR为比值比，也称优势比

当我们已知疾病的发生状况，比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时（即回顾性研究时），用OR进行定量描述。OR是否有意义还要看其P值，一般95%CI上限小于1时说明可能是保护因素，相反如果下限大于1则说明可能是危险因素。}

ln(OR)近似服从正态分布，因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间，再计算OR置信区间（参考：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1127651/，http://bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf，http://www.sjsu.edu/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf）

^{参考资料1（维基）：http://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio#}

定义：Definition interms of group-wise odds

Ifthe probabilities of the event in each of the groups arep₁ (first group) andp₂ (secondgroup), then the odds ratio is:

whereq_x = 1 − p_x.An odds ratio of 1 indicates that the condition or event understudy is equally likely to occur in both groups.

参考资料2：http://www.bioinformatics.org/snp-tools-excel/

例子1：

例子2：

参考资料3：blackwell出版社

http://www.blackwellpublishing.com/specialarticles/jcn_10_268.pdf

参考资料4：http://intmedweb.wfubmc.edu/ebmreviews/odds.html

参考资料5：http://hydra.usc.edu/scehsc/pdfs/D-1-3-3lesson calculating odds.pdf

参考资料6 ：http://stanford.edu/class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf

参考资料7: http://www.statsdirect.com/help/exact_tests_on_counts/gart.htm（介绍了OR和RR区别和联系）

博文来源于：http://blog.sina.com.cn/s/blog_4af3f0d20100b9dh.html~type=v5_one&label=rela_nextarticle

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