关于使用Cytoscape软件合并多个网络图

发布于2021年10月22日

最近在使用Cytoscape绘制基因-转录因子的调控网络图，想绘制这种包含正负调控关系以及对样本的调控关系的网络图。

虽然很简单的方法，但是网上的帖子基本都是在水，这里给出一个简单绘制该网络图的方法。

首先文件里应该标明网络图里的对象关系

然后根据表格，构建两个网络图

第一个，将转录因子作为source Node，将target_gene作为target Node：

第二个，将target_gene作为source Node，将sample作为target Node：

然后在“tools”选项卡中找到“Merge”，“Networks”，选择刚才的两个网络，就会正常需要的一个调控网络了。

关于使用Cytoscape软件合并多个网络图相关推荐

Cytoscape软件的基本使用
前言 Cytoscape是一款开源软件,可以用于可视化网络和分析.接下来将简单介绍软件的安装与使用. Cytoscape官网 Cytoscape安装下载软件:Cytoscape Cytoscape软 ...
[转载]无需软件合并多个TS流文件
[转载]无需软件合并多个TS流文件可以使用以下DOS命令达到目的(即"开始"菜单,"运行",输入 cmd 再按回车): (此处假设你要合并的高清文件位于 E: ...
2018年SCI论文--整合GEO数据挖掘完整复现八：STRING数据库构建蛋白质相互作用网络（PPI），cytoscape软件筛选hub基因
文章目录论文地址 STRING数据库 PPI网络构建输入差异基因list PPI图保存结果 cytoscape软件筛选hub基因.功能模块输入"string_interactions ...
两个mp3文件合成 php,两个音频合成一个音频合成软件/音频视频合成软件合并不同格式为一个音频文件...
怎么将两个音频合成一个音频文件,嗯~ o(*￣▽￣*)o ,又是一个老生常谈的话题,但既然是提到了自然是再给大伙演示一下,那就使用一个比较简单的音频合成软件/音频视频合成软件合并不同格式为一个音频文件 ...
软件项目管理知识回顾---网络图
网络图 9.网络图 9.1简介 1.分类 AOA,双代号,ADM AON,PDM,单代号,前导图 2.活动的逻辑管理头到头/尾,尾到头/尾依赖关系 3.工序紧前紧后 9.2绘制规则 1.两个节 ...
无需软件合并多个TS流文件
可以使用以下DOS命令达到目的(即"开始"菜单,"运行",输入 cmd 再按回车): (此处假设你要合并的高清文件位于 E:\temps 这个位置) copy ...
蓝代斯克与HEAT软件合并新公司取名“Ivanti”
2月13日,Clearlake Capital Group, L.P.(与其子公司统称为"Clearlake")近日宣布已完成对蓝代斯克的收购.该交易结束的同时,蓝代斯克和HEAT ...
使用PaupGUI软件合并一致性树consensus tree
PAUP是一款用于构建进化树(系统发育树)及进行相关检验的软件.本文解决的问题是How to create consensus phylogenetic tree by PaupGUI. 适用情形: ...
使用在线软件合并pdf论文文件安全吗？不妨使用简单的python代码
执行代码之前,使用下面命令安装pypdf2的python库 pip install pypdf2 python代码: import PyPDF2 pdf1File = open('PDFFile1.p ...

关于使用Cytoscape软件合并多个网络图

关于使用Cytoscape软件合并多个网络图相关推荐

最新文章

热门文章