近9分的生信杂志发了一篇Venn图工具大比拼

2021年4月12日，西南大学前沿交叉学科研究院生物学研究中心王翊教授研究组在生物信息学领域top期刊《Briefings in Bioinformatics》上发表题为“Venn diagrams in bioinformatics”的综述论文。

文氏图是被广泛用于图形化描绘多个数据集之间的并集，交集和区别的工具，目前已经开发了大量的程序来生成文氏图，以用于各个研究领域。但是，当前尚未研究对这些工具进行全面的比较和综述。在本文中，我们收集了文氏图生成器（即，仅用文氏图用于可视化几个数据集之间的关系）和维恩图应用程序工具（即，分析生物数据之间的关系并在文氏图中进行可视化）并比较它们的功能如下：生成高质量图表的能力；每个程序能处理的最大数据集；输入数据格式；输出图片样式和导出图像的格式。我们还根据图形布局来评估文氏图生成器的图片美化参数，并简要概述了最流行的文氏图应用工具的功能特性。最后，我们讨论了文氏图应用程序工具所面临的挑战，并对文氏图在生物信息学中的应用提供了新视角。我们的目标是协助用户选择合适的工具来分析和可视化他们自定义的数据集。

王教授团队是OrthoVenn系列软件的开发团队，于2019年推出OrthoVenn2，对venn图和软件开发有很多经验。

西南大学博士生贾安强和加州大学伯克利分校博士后徐凌为论文共同第一作者，王翊教授为通讯作者，西南大学为第一完成单位。该工作受到了国家自然科学基金项目，西南大学科学研究启动资金和中央高校基本科研业务费，以及重庆市留学人员创新创业人才培养计划项目的支持。

论文链接：https://doi.org/10.1093/bib/bbab108.

推荐EVenn，全新改版，上传一个文件，支持全部图形绘制

http://www.ehbio.com/test/venn/#/ （点击阅读原文直达）

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