单个计算任务的提交

How to compute by Gaussian 03?

1. Upload "xxx.gjf" to your folder.

2. Perform "g03 xxx.gjf &" in your folder.

3. See your tasks by "jobs", it's running. Ok!

How to run a Fortran code?

1. Upload "xxx.f90" to your folder.

2. Perform "gfortran xxx.f90 -o xxx" in your folder.

3. Perform "./xxx &".

4. See your tasks by "jobs", it's running. Ok!

How to stop a running task?

1. Perform "ps" or "top", find the "pid" corresponging to the task you want to stop.

2. Perform "kill -9 pid", if not, perform "kill -15 pid".

3. See your tasks by "jobs", it disappears. Ok!

多个计算任务依次执行(即批处理)

以Gaussian计算为例，新建一个文件，比如batch，不需要文件类型扩展名。输入如下内容：

g03 xx1.gjf

g03 xx2.gjf

……

执行“chmod u+x batch”改变其权限，使其可执行。

如果不是unix格式，就使用“dos2unix batch”把Windows格式转换到Unix格式。

执行“./batch &”。Ok!

让任务在后台运行

在我的机子测试中，仅仅按上面的操作，即只在命令末尾加“&”，就可以在后台运行了。如果不行，还可以使用下面的方法。以Gaussian计算为例

1. nohup方法："nohup g03 xxx.gjf &"

2. setsid方法："setsid g03 xxx.gjf"

3. ()方法："(g03 xxx.gjf &)"

4. 补救措施。把已经提交的任务转到后台运行。

"disown -h %n" n是作业号，利用jobs查看

"disown -ah" 使所有的作业都忽略HUP信号

"disown -rh" 使正在运行的作业忽略HUP信号

5. screen方法

如果有大量的任务需要在后台运行，又不想每次都使用上面的命令这么麻烦，可以使用screen方法。

注意：用终端提交完任务后，用logout或exit正常退出，别直接点右上角的叉叉，否则会出现后台命令失效的情况。

其他常用命令

1. 查看cpu “cat /proc/cpuinfo”

物理CPU数 “cat /proc/cpuinfo | grep 'physical id' | sort | uniq | wc -l”

每个CPU的核数 “cat /proc/cpuinfo | grep 'physical id' | grep '0' | wc -l”

逻辑CPU数“cat /proc/cpuinfo | grep 'processor' | wc -l”

(写作格式：“grep 'model name' /proc/cpuinfo”)

2. 查看Linux版本 “cat /proc/version”、“uname -a”

3. 查看操作系统版本 “cat /etc/issue”

4. 查看操作系统位数 “arch”、“uname -m”、“getconf LONG_BIT”、“cat /proc/cpuinfo | grep flags | grep ' lm ' | wc -l”

5. 查看计算机名 “hostname”

6. 查看内存 “cat /proc/meminfo”、“free -m”

7. 查看硬盘 “df -h”

8. 统计目录 “du -m”

9. 实时信息 top

10. 查看进程 “ps -ux”、“ps -ef | grep pid”

11. 只允许root登录：在/etc目录中执行“touch nologin”，删除产生的nologin文件即可恢复用户

12. 查询一个包是否被安装 “rpm -q xxx”、“rpm -qa | grep xxx”

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