GOA:Gene Ontology注释信息数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!

GOA全称Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI构建的一个GO注释信息的数据库。官网如下

https://www.ebi.ac.uk/GOA

该数据库提供了以下3种生物分子的GO注释信息

来自UniProtKB数据库的蛋白
来自RNACentral数据库的RNA
来自Complex数据库的蛋白复合物

GOA数据库的注释信息不仅包括由Gene Ontology委员会的专家们提供的手工注释，还包括由生物信息软件注释得到的GO注释信息。详细的来源如下

GOA的注释信息可以通过QuickGO进行浏览，官网上则提供了FTP下载功能，主要包含以下2种文件

1. GO注释信息

提供了UniProtKB数据库中蛋白对应的GO注释信息，同时对于常见的物种，还单独提供了注释文件。

2. Go Mapping 文件

提供了其他数据库的ID和GO ID之间的对应关系，列表如下

FTP的地址如下

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa

GOA的注释信息通过QuickGO进行浏览和检索，通过FTP服务则可以下载对应的原始注释信息。

扫描关注微信号，更多精彩内容等着你！

GOA:Gene Ontology注释信息数据库相关推荐

gff文件_如何提取gff文件中的基因注释信息
原标题:如何提取gff文件中的基因注释信息 gff3格式注释文件是最常见的基因注释,(https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/g ...
一文极速读懂 Gene Ontology （GO）数据库
一.介绍官方:基因本体(GO)知识库是有关基因功能的全球最大信息来源. 这些知识既是人类可读的,也是机器可读的,并且是生物医学研究中大规模分子生物学和遗传学实验的计算分析的基础. 在读懂基因本体论( ...
mysql查询时给字段加内容,mysql数据库查询之对应库对应表中的注释信息查询以及加字段查询...
select * from information_schema.columns where table_schema = 'db' #表所在数据库 and table_name = 'tablena ...
Gene Ontology 的GO注释的可视化
Gene Ontology 的GO注释的可视化@TOC 利用goatools和PyGraphviz可视化最近因为项目的原因,需要对GO terms的注释进行可视化,在此之前已经使用visio自己画了 ...
如何从jdbc中获取数据库建表语句信息(表字段名称/表字段类型/表字段注释信息/表字段长度等等)
* 如何从jdbc中获取数据库建表语句信息(表字段名称/表字段类型/表字段注释信息/表字段长度等等) * 1,表字段名称 * 2,表字段类型 * 3,表字段注释信息这里介绍3种方式,如下: 第 ...
linux下kegg注释软件,KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载
KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载 KEGG数据库pathway相关数据下载我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway . 前面我们介绍了KEGG 数据 ...
怎么导出mysql数据库注释_数据库基础：如何查看并导出数据表中字段的注释信息...
查看并导出SQL Server 2000数据表中字段的注释信息: 此示例为导出某个表注释的语句:(表名是bbs_bank_log) SELECT sysobjects.name AS 表名, sysc ...
gene Ontology （基因本体论）
gene ontology为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找 ...
ncbi查找目的基因序列_NCBI gene: 基因相关信息查询
我们在进行基因相关研究的时候,如果要研究一个基因,那么首先要知道这个基因的一些基本信息,检索基因相关的网站还是很多的.其中比较出名的还是genecards.一个汇总的了很多数据库的的综合性基因查询网站 ...

GOA:Gene Ontology注释信息数据库

1. GO注释信息

2. Go Mapping 文件

GOA:Gene Ontology注释信息数据库相关推荐

最新文章

热门文章