linux下kegg注释软件,KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载
KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载
KEGG数据库pathway相关数据下载
我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway 。 前面我们介绍了KEGG 数据库中蛋白序列的下载方式,现在来介绍一下patyway 相关数据的下载方式。这个主要采用KEGG 的API进行获取,思路如下:
1. KEGG 有那些pathway ?
访问的API地址是:
http://rest.kegg.jp/list/pathway
通过该API ,可以获得所有pathway的列表。
2. pathway 上有那些KO (KEGG 中的ID编号)
访问的API地址是:
其中map00010 就是对于的pathway 图的编号,通过遍历所有的pathway ,就可以kegg 数据库中跟pathway 相关KO。
3. KO 对应的蛋白编号是哪个?
访问API地址:
http://rest.kegg.jp/link/genes/K00500
其中K00500 就是我们在第二步中获得的KO, 通过遍历所有的KO,就可以获得在KO在不同物种中的基因(蛋白)编号。
linux下kegg注释软件,KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载相关推荐
- linux设置定时备份任务,Linux下Oracle设置定时任务备份数据库的教程
1.查看数据库的字符集 数据库的字符集必须和linux下设置的环境变量一致,不然会有乱码. 以下两个sql语句都可以查到: select * from nls_database_parameters ...
- oracle定时任务可以备份么,Linux下Oracle设置定时任务备份数据库的教程
1.查看数据库的字符集 数据库的字符集必须和Linux下设置的环境变量一致,不然会有乱码. 以下两个sql语句都可以查到: select * from nls_database_parameters ...
- linux下使用的mysql数据库,Linux下安装以及使用MySQL数据库
1.官网下载mysql数据库:https://dev.mysql.com/downloads/mysql/ 2.linux 下可直接下载:wget https://cdn.mysql.com//Dow ...
- windows、linux下命令行登录oracle数据库方法,查询sga参数值sql语句
windows 下 cmd 命令行登录 oracle 数据库方法.直接就登录进来了. C:\Users\Administrator>sqlplusSQL*Plus: Release 11.2.0 ...
- Linux 下如何安装软件?
http://zhidao.baidu.com/link?url=OkQCOZtVMXhasC8x9zFTZOumsFKf0WW25Ckr2wBF1xO08EsjrBpnMaTBlIAUYdxZ408 ...
- Linux下运行纯dos软件,在linux下运行dos软件(转)
在linux下运行dos软件(转)[@more@]在linux系统上运行的dosemu软件包使你能在linux环境运行许多dos软件. [安装] DOSEMU处于不断进行修改和升级的过程中.它在不断增 ...
- Linux下使用C++操作redis数据库
Linux下使用C++操作redis数据库 文章目录 Linux下使用C++操作redis数据库 一.安装配置hiredis.h 二.接口介绍 1.**`建立链接:redisConnect`** 2. ...
- linux 下外语学习软件_学习外语如何帮助您学习编码
linux 下外语学习软件 The road to becoming a software developer is a long and difficult one, especially for ...
- linux下软件的卸载,Linux下各种格式软件的安装及卸载方法
使用Linux系统的人都知道,Linux系统下软件的安装可不像Windows下,双击,一路NEXT下去就可以,在LInux下常用的软件主要有deb,rpm,tar.gz,bin等格式,那么下面我给大家 ...
最新文章
- 近期活动盘点:第一届“数据故事计划”、“新世界,由你造”阿里菜鸟2019实习生招聘...
- 微信小程序onLoad与onShow的区别
- LoadRunner监控局域网内其他服务器系统资源设置
- 计算机c语言二级题型,计算机二级C语言题型和评分标准
- 【linux】设置镜像源
- python直方图教程_python如何画直方图
- [转] Difference between Abstract classes and Interfaces
- python和c语言的区别-c语言和python的区别是什么
- PHP表单header post get
- RyuBook1.0案例三:REST Linkage
- 【Office 365 2108更新】
- 相似矩阵、矩阵的相似对角化
- mathematica 矩阵对角化
- 【多式联运】基于模拟退火优化遗传算法求解多式联运运输问题(含碳政策)含Matlab代码
- outlook配置阿里企业邮箱
- 【Linux】一张图让你读懂Linux内核运行原理
- MySql中数据表增加字段很慢
- 11月末.wang域名总量15强:易名中国榜首 份额涨5%
- 个人Gmail跟MSN邮箱账号,怕忘记
- tf.greater(a,b)
热门文章
- Android 小游戏之星陨大战 详解
- python 元组_python 元组操作总结
- 看完这篇博客如果你还不知道怎么用charles连接手机算我输
- 对jiq中一段程序以及prepare_to_wait的理解
- Eclipse导入和调试别人的Java web项目完整教程(超详细,包括报错解决)
- 颠覆了我的世界观...就软件测试能干到多少岁?
- python PyQt5安装步骤
- 【Computer Vision】基于VGG-16实现中草药分类
- 笔记-13-多线程 Thread方法 线程安全 生产者和消费者 死锁和阻塞
- Windows键盘操作