首先要安装mysql驱动程序包，详细步骤如下：

Step 1: 将mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar文件拷贝到......\MATLAB\R2009a\java\jar\toolbox

Step 2: 到......\MATLAB\R2009a\toolbox\local目录下，找到classpath.txt文件，打开，并添加用来加载mysql的jdbc驱动语句：

$matlabroot/java/jar/toolbox/mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar

Step 3:重新打开MATLAB即可

驱动程序安装成功后，接来下要是matlab连接mysql数据库的代码：

conn =database('databasename','username','password','driver','databaseurl')

连接成功后，返回连接对象。

参数如下：

*databasename: 数据库名称.

*driver: JDBC driver.

*username and password: 用户名和密码.

*databaseurl: 类似于jdbc:subprotocol:subname. subprotocol 是数据库类型,

subname 类似于//hostname:port/databasename.

如果matlab和数据库建立了连接，将返回类似于如下信息：

Instance: 'SampleDB'

UserName: ''

Driver: []

URL: []

Constructor: [1x1 com.mathworks.toolbox.database.databaseConnect]

Message: []

Handle: [1x1 sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcConnection]

TimeOut: 0

AutoCommit: 'off'

Type: 'Database Object'

连接mysql的代码如下：

conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');

连接成功后，就可以用exec函数执行sql语句

exec函数执行sql语句并返回一个开指针

语法如下：

curs = exec(conn,'sqlquery')例如：curs = exec(conn, 'select * from customers')

执行完查询后，还要将查询结果从开放cursor对象导入到对象curs中，该功能是用

cursor.fetch函数实现的。

语法如下：

curs = fetch(curs)

使用curs.Data来显示数据，curs.Data返回一个CELL结构，可以先把CELL结构转换成

MATRIX结构再取值：

cur =cell2mat(cur)

a=cur(1,1);

则查询结果就加到了向量a中

注意：

在exec函数执行查询过程中，有的sql语句要输入变量，这时可使用strcat函数完成该

功能。

t = strcat(s1, s2, s3, ...)for(t=1:10)

sql1 = strcat('select count(did) from rss_genepairs_u where gocc>=',num2str(t),' || gomf >= ',num2str(t),' || gobp >= ',num2str(t));

end

完整代码如下：

conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');

for t=0.5:0.01:0.91

for x=0.5:0.1:11

sql = strcat('select count(did) from rss_genepairs_x2 where score <=',num2str(x),' and did in(select did from rss_genepairs_u where gocc >=',num2str(t),' || gomf >= ',num2str(t),' || gobp >= ',num2str(t),')');

aTemp = exec(conn,sql);

aTemp = fetch(aTemp);

a = aTemp.Data;

a = cell2mat(a);

a= a(1,1);

end

end