【UCSC Genome Browser】- 小技巧

2024-06-01 15:56:12

【UCSC Genome Browser】- 小技巧

Browser 视图介绍

UCSC Genome Browser根据基因组位置信息，将不同数据库以track（轨道）的方式聚合在同一个视图中，使得研究人员可以进行多层次的比较和分析。

我们选择几个track（数据库）进行展示，不同的track可能有不同的展示方式，在后续的文章中我们会逐个介绍。

Browser 配置

点击视图下方的configure 按钮，可以对浏览器进行设置。

image width 可以根据自己的显示器宽度调节；
abel area width 指的是视图左边栏的宽度；
text size 指的是视图中所有字体的大小；
其他是一些细节的设置，可以根据自己的需要进行设置。

快捷键

键盘输入 ? 会弹出快捷键清单，提高使用效率。

我们说几个比较实用的

高亮目标区域 按住Alt，鼠标左键选择目标区域，会以不同颜色进行标记，可以选择多个区域，且放大缩小视图这些区域不会消失，右键选择 Remove highlight可以取消高亮

扩展选择区域 按住Ctrl，鼠标左键选择目标区域，会将该区域铺满整个试图

h then m 按h快速松开快速按m，可以标记/高亮当前整个视图

h then c 取消高亮

v then d 根据基因坐标选择DNA序列，需要注意参考基因组版本的选择

右键选择

视图中的所有位置都可以尝试点击鼠标右键 或者 点击鼠标中键会有更多收获。

Open details page in new window 可以展示更详尽的信息

数据库选择

视图中每个数据库展示一个

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