泪奔,配好了bioconductor环境
最近因为极度忙,没有写总结。今天补一下总结。
今天完成关静最后给的大project这个作业来说,结合自己的研究方向是个让我纠结一周多的事。好在找到了对应的研究内容。
R的书目前还是很多的。R我一开始觉得比较好用,甚至还有RStudio以及可视化效果。但是最后这个作业居然有个包下载后居然提示要3.0之前的R才能用。
http://www.dxy.cn/bbs/topic/32033578
丁香园里这位老兄说没装DBI包,于是装了,但是libraray("hgu95av2")还是不行呢。- -!
费了一个小时,找到了办法:
首先我下载的是这两个包:hgu95av2.db,org.Hs.eg.db。试了很多改里面文件配置的方法都不奏效。为了稳妥,在虚拟机里按照编译器的提示装了一个2.14版的R,然后libraray("hgu95av2"),居 然说AnnotationDbi没找到- -! 于是使用
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("AnnotationDbi")
试了好几次,都说超时,第四次终于加载成功。
之后在3.2.2里面使用libraray("hgu95av2")就可以了^_^
相关网址:
http://www.bioconductor.org/install/index.html#find-bioconductor-packages
http://permalink.gmane.org/gmane.science.biology.informatics.conductor/46015
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AnnotationDbi.html
转载于:https://www.cnblogs.com/ubiwind/p/5312567.html
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