nii与nii.gz格式的关系

标准NIfTI图像的扩展名是.nii，包含了头文件及图像资料。由于NIfTI格式和Analyze格式的关系，因此NIfTI格式也可使用独立的图像文件[.img]和头文件[.hdr]。单独的.nii格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件[如gzip]，而且一些分析软件包[比如FSL]可以直接读取和写入压缩的.nii文件[扩展名为.nii.gz]。

简而言之，nii格式和.nii.gz格式是一个东西，freesurfer中可以直接调用除了dicom和.nii.gz也可以直接调用.nii

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